Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3016 Pepper.v.1.5.chr01 102192119 1e-116
CaES4663 Pepper.v.1.5.chr01 102797693 1e-91
CaES4277 Pepper.v.1.5.chr01 103373191 5e-87
CaES3363 Pepper.v.1.5.chr01 105024915 7e-81
CaES4046 Pepper.v.1.5.chr01 105024915 3e-29
CaES4376 0.396 149 Pepper.v.1.5.chr01 108109688 5e-26
CaES1483 Pepper.v.1.5.chr01 116916162 7e-96
CaES3453 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr01 117258931 2e-56
CaES5180 Pepper.v.1.5.chr01 117507432 1e-128
CaES2454 Pepper.v.1.5.chr01 117891630 7e-61
CaES4273 Pepper.v.1.5.chr01 118506642 1e-161
CaES1348 Pepper.v.1.5.chr01 118506978 1e-119
CaES0688 Pepper.v.1.5.chr01 119625969 1e-139
CaES1976 Pepper.v.1.5.chr01 121848101 1e-105
CaES5357 Pepper.v.1.5.chr01 123217772 6e-45
CaES2096 Pepper.v.1.5.chr01 123490221 1e-108
CaES1435 Pepper.v.1.5.chr01 125646596 1e-109
CaES4000 Pepper.v.1.5.chr01 125646776 1e-110
CaES0731 Pepper.v.1.5.chr01 125647141 1e-121
CaES0098 Pepper.v.1.5.chr01 126797534 3e-53
CaES2240 Pepper.v.1.5.chr01 126798978 4e-48
CaES4202 Pepper.v.1.5.chr01 126799564 1e-55
CaES0435 Pepper.v.1.5.chr01 126933560 6e-76
CaES5614 Pepper.v.1.5.chr01 129074590 1e-113
CaES2743 Pepper.v.1.5.chr01 129560478 1e-114
CaES4478 Pepper.v.1.5.chr01 130059975 3e-38
CaES0297 Pepper.v.1.5.chr01 131089159 1e-148
CaES2049 Pepper.v.1.5.chr01 134187946 1e-110
CaES2706 Pepper.v.1.5.chr01 134797779 8e-45
CaES3276 Pepper.v.1.5.chr01 136678109 1e-113
CaES2848 Pepper.v.1.5.chr01 136814232 1e-145
CaES3899 Pepper.v.1.5.chr01 138442658 4e-30
CaES3136 Pepper.v.1.5.chr01 139344446 1e-116
CaES5202 Pepper.v.1.5.chr01 140848941 2e-30
CaES4576 Pepper.v.1.5.chr01 140851600 1e-82
CaES1827 Pepper.v.1.5.chr01 140872241 9e-97
CaES4580 Pepper.v.1.5.chr01 141871002 1e-136
CaES3105 Pepper.v.1.5.chr01 144971692 2e-85
CaES3023 Pepper.v.1.5.chr01 144973914 1e-103
CaES5751 Pepper.v.1.5.chr01 147663939 7e-65
CaES3342 Pepper.v.1.5.chr01 148074583 8e-57
CaES3077 Pepper.v.1.5.chr01 150395283 2e-61
CaES3863 Pepper.v.1.5.chr01 150483346 2e-32
CaES2214 Pepper.v.1.5.chr01 151900806 1e-122
CaES2100 Pepper.v.1.5.chr01 153208390 1e-94
CaES2174 Pepper.v.1.5.chr01 153329695 3e-89
CaES5137 Pepper.v.1.5.chr01 153371333 1e-106
CaES2637 Pepper.v.1.5.chr01 153373060 1e-142
CaES2287 Pepper.v.1.5.chr01 153381929 8e-67
CaES4671 Pepper.v.1.5.chr01 153452772 1e-97
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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