Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2284 Pepper.v.1.5.chr01 34133566 9e-26
CaES2075 Pepper.v.1.5.chr01 34302528 1e-115
CaES2458 Pepper.v.1.5.chr01 35529312 2e-62
CaES3962 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr01 35553286 1e-127
CaES0290 Pepper.v.1.5.chr01 35559816 1e-125
CaES4187 Pepper.v.1.5.chr01 35890048 1e-77
CaES1361 Pepper.v.1.5.chr01 35948107 2e-75
CaES5743 Pepper.v.1.5.chr01 35965924 3e-42
CaES3999 Pepper.v.1.5.chr01 36927420 1e-119
CaES0419 Pepper.v.1.5.chr01 37001150 2e-75
CaES3727 Pepper.v.1.5.chr01 37087608 1e-139
CaES1440 Pepper.v.1.5.chr01 37525997 4e-44
CaES5485 Pepper.v.1.5.chr01 37553721 1e-57
CaES4015 Pepper.v.1.5.chr01 37568247 1e-145
CaES3335 Pepper.v.1.5.chr01 37611785 2e-44
CaES2104 Pepper.v.1.5.chr01 37629936 3e-90
CaES0774 Pepper.v.1.5.chr01 37630304 4e-78
CaES4434 Pepper.v.1.5.chr01 37815720 9e-83
CaES5301 0.432 188 Pepper.v.1.5.chr01 38037199 1e-36
CaES2008 Pepper.v.1.5.chr01 38772507 1e-132
CaES0902 Pepper.v.1.5.chr01 38783211 1e-127
CaES3418 Pepper.v.1.5.chr01 38952286 1e-136
CaES1717 Pepper.v.1.5.chr01 39812874 1e-115
CaES1971 Pepper.v.1.5.chr01 40240790 6e-37
CaES3056 Pepper.v.1.5.chr01 40321267 1e-124
CaES4265 Pepper.v.1.5.chr01 40335317 1e-147
CaES4402 Pepper.v.1.5.chr01 41177157 1e-153
CaES1940 Pepper.v.1.5.chr01 41181802 1e-132
CaES5623 Pepper.v.1.5.chr01 41570925 4e-87
CaES1197 Pepper.v.1.5.chr01 41571308 6e-62
CaES3145 Pepper.v.1.5.chr01 43866168 2e-92
CaES1207 Pepper.v.1.5.chr01 43963689 1e-122
CaES4204 Pepper.v.1.5.chr01 44314362 1e-104
CaES5548 Pepper.v.1.5.chr01 44403223 1e-105
CaES3316 Pepper.v.1.5.chr01 44430027 3e-58
CaES2536 Pepper.v.1.5.chr01 44846910 1e-111
CaES5002 Pepper.v.1.5.chr01 44977678 1e-103
CaES1346 Pepper.v.1.5.chr01 44984281 1e-74
CaES3334 Pepper.v.1.5.chr01 45007739 6e-80
CaES1630 Pepper.v.1.5.chr01 49123283 3e-84
CaES4238 Pepper.v.1.5.chr01 49235561 1e-126
CaES0997 Pepper.v.1.5.chr01 50155999 6e-71
CaES4619 Pepper.v.1.5.chr01 51394325 1e-141
CaES0441 Pepper.v.1.5.chr01 52129018 1e-94
CaES1120 Pepper.v.1.5.chr01 55768953 1e-79
CaES3724 Pepper.v.1.5.chr01 55797869 2e-92
CaES1922 Pepper.v.1.5.chr01 55824159 1e-102
CaES4404 Pepper.v.1.5.chr01 56921542 2e-72
CaES2708 Pepper.v.1.5.chr01 56969976 1e-143
CaES2736 Pepper.v.1.5.chr01 56970218 1e-128
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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