Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES5100 Pepper.v.1.5.chr01 13508132 1e-79
CaES2261 Pepper.v.1.5.chr01 13508861 1e-123
CaES2665 Pepper.v.1.5.chr01 14556376 3e-84
CaES3957 Pepper.v.1.5.chr01 14608718 2e-67
CaES5517 Pepper.v.1.5.chr01 14744970 3e-46
CaES5069 Pepper.v.1.5.chr01 14744973 1e-114
CaES2181 Pepper.v.1.5.chr01 14781998 1e-75
CaES2014 Pepper.v.1.5.chr01 14787923 1e-122
CaES0782 Pepper.v.1.5.chr01 15417507 2e-83
CaES2241 Pepper.v.1.5.chr01 15624324 2e-43
CaES1614 Pepper.v.1.5.chr01 15741252 1e-138
CaES4270 Pepper.v.1.5.chr01 15849828 1e-160
CaES0660 Pepper.v.1.5.chr01 15851009 1e-160
CaES1363 Pepper.v.1.5.chr01 16227267 1e-91
CaES4276 Pepper.v.1.5.chr01 16390293 3e-53
CaES4223 Pepper.v.1.5.chr01 16518256 8e-54
CaES4014 Pepper.v.1.5.chr01 16943331 1e-111
CaES2482 Pepper.v.1.5.chr01 16968289 1e-92
CaES1864 Pepper.v.1.5.chr01 17433388 1e-122
CaES2105 Pepper.v.1.5.chr01 17581046 4e-67
CaES5588 Pepper.v.1.5.chr01 17639983 3e-77
CaES4063 Pepper.v.1.5.chr01 19332894 1e-143
CaES0668 Pepper.v.1.5.chr01 19551238 6e-98
CaES3365 Pepper.v.1.5.chr01 19877421 3e-59
CaES5151 Pepper.v.1.5.chr01 20192866 5e-70
CaES3293 Pepper.v.1.5.chr01 21824813 1e-47
CaES5212 Pepper.v.1.5.chr01 21824909 4e-45
CaES4491 Pepper.v.1.5.chr01 21987484 9e-56
CaES5466 Pepper.v.1.5.chr01 23000438 2e-61
CaES4781 Pepper.v.1.5.chr01 23485716 1e-128
CaES0969 Pepper.v.1.5.chr01 23495620 1e-133
CaES2959 Pepper.v.1.5.chr01 23777589 5e-82
CaES2659 Pepper.v.1.5.chr01 23815116 3e-46
CaES3277 Pepper.v.1.5.chr01 24602467 1e-112
CaES2540 Pepper.v.1.5.chr01 26617045 1e-107
CaES1783 Pepper.v.1.5.chr01 26617169 6e-27
CaES3333 Pepper.v.1.5.chr01 27478165 3e-94
CaES2079 Pepper.v.1.5.chr01 27736373 1e-96
CaES4032 Pepper.v.1.5.chr01 27753810 7e-83
CaES0696 Pepper.v.1.5.chr01 27761153 3e-67
CaES2407 Pepper.v.1.5.chr01 27782216 1e-118
CaES1872 Pepper.v.1.5.chr01 27970435 9e-30
CaES3165 Pepper.v.1.5.chr01 29626196 1e-126
CaES4459 Pepper.v.1.5.chr01 29852204 3e-50
CaES4167 Pepper.v.1.5.chr01 29869893 1e-118
CaES4581 Pepper.v.1.5.chr01 29870714 1e-148
CaES3231 Pepper.v.1.5.chr01 30105031 3e-87
CaES0599 Pepper.v.1.5.chr01 30746155 1e-146
CaES3111 Pepper.v.1.5.chr01 30747187 1e-123
CaES4698 Pepper.v.1.5.chr01 32430959 1e-95
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


MarkerDB | Capsicum annuum