Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0013 Pepper.v.1.5.chr12 213178142 4e-23
CaES0019 Pepper.v.1.5.chr12 19791947 5e-57
CaES0030 Pepper.v.1.5.chr12 9636903 2e-21
CaES0034 Pepper.v.1.5.chr12 76636069 2e-73
CaES0048 Pepper.v.1.5.chr12 222418925 3e-98
CaES0073 Pepper.v.1.5.chr12 232169391 5e-70
CaES0113 Pepper.v.1.5.chr12 7955964 1e-103
CaES0133 Pepper.v.1.5.chr12 1788315 1e-135
CaES0151 Pepper.v.1.5.chr12 177377650 1e-149
CaES0173 Pepper.v.1.5.chr12 174451961 1e-49
CaES0193 Pepper.v.1.5.chr12 222034268 1e-83
CaES0203 Pepper.v.1.5.chr12 21023555 1e-141
CaES0220 Pepper.v.1.5.chr12 86826964 4e-51
CaES0222 Pepper.v.1.5.chr12 217802625 4e-22
CaES0226 Pepper.v.1.5.chr12 231377473 1e-107
CaES0230 Pepper.v.1.5.chr12 229717585 3e-96
CaES0236 Pepper.v.1.5.chr12 223416666 1e-130
CaES0250 Pepper.v.1.5.chr12 1788740 1e-64
CaES0274 Pepper.v.1.5.chr12 125581 1e-131
CaES0277 Pepper.v.1.5.chr12 230501683 2e-92
CaES0309 Pepper.v.1.5.chr12 9878175 1e-125
CaES0320 Pepper.v.1.5.chr12 16986960 1e-127
CaES0334 Pepper.v.1.5.chr12 12498002 5e-82
CaES0353 Pepper.v.1.5.chr12 217770938 1e-130
CaES0377 Pepper.v.1.5.chr12 155470346 1e-123
CaES0387 Pepper.v.1.5.chr12 224929565 2e-94
CaES0413 Pepper.v.1.5.chr12 63088333 1e-108
CaES0415 Pepper.v.1.5.chr12 228152324 1e-113
CaES0426 Pepper.v.1.5.chr12 204765446 1e-39
CaES0437 Pepper.v.1.5.chr12 5640894 2e-77
CaES0438 Pepper.v.1.5.chr12 214004105 1e-77
CaES0449 Pepper.v.1.5.chr12 231709889 6e-91
CaES0473 Pepper.v.1.5.chr12 181672246 1e-62
CaES0488 Pepper.v.1.5.chr12 129381248 1e-48
CaES0491 Pepper.v.1.5.chr12 36942210 1e-118
CaES0522 Pepper.v.1.5.chr12 3157665 1e-117
CaES0575 Pepper.v.1.5.chr12 33526607 7e-27
CaES0576 Pepper.v.1.5.chr12 120698679 1e-102
CaES0577 Pepper.v.1.5.chr12 11156247 2e-38
CaES0608 Pepper.v.1.5.chr12 1287713 5e-75
CaES0650 Pepper.v.1.5.chr12 7608512 3e-65
CaES0656 Pepper.v.1.5.chr12 74467150 1e-127
CaES0657 Pepper.v.1.5.chr12 230152774 2e-90
CaES0667 Pepper.v.1.5.chr12 231350392 4e-71
CaES0690 Pepper.v.1.5.chr12 9131096 1e-112
CaES0691 Pepper.v.1.5.chr12 226054187 1e-101
CaES0711 Pepper.v.1.5.chr12 6937283 1e-133
CaES0722 Pepper.v.1.5.chr12 175993516 1e-113
CaES0743 Pepper.v.1.5.chr12 77599190 1e-107
CaES0744 Pepper.v.1.5.chr12 221866002 2e-46
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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