Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES4730 Pepper.v.1.5.chr12 230104924 1e-126
CaES0657 Pepper.v.1.5.chr12 230152774 2e-90
CaES1237 Pepper.v.1.5.chr12 230195977 1e-128
CaES4872 Pepper.v.1.5.chr12 230343656 1e-100
CaES0277 Pepper.v.1.5.chr12 230501683 2e-92
CaES5116 Pepper.v.1.5.chr12 230579243 9e-81
CaES2542 Pepper.v.1.5.chr12 230594504 1e-112
CaES5546 Pepper.v.1.5.chr12 230599722 2e-55
CaES4469 Pepper.v.1.5.chr12 230702387 1e-138
CaES4261 Pepper.v.1.5.chr12 230804191 1e-115
CaES3955 Pepper.v.1.5.chr12 230856407 1e-117
CaES4795 Pepper.v.1.5.chr12 230858848 5e-84
CaES4926 Pepper.v.1.5.chr12 231296214 1e-140
CaES4669 Pepper.v.1.5.chr12 231320739 1e-116
CaES0667 Pepper.v.1.5.chr12 231350392 4e-71
CaES5355 Pepper.v.1.5.chr12 231361083 1e-101
CaES0226 Pepper.v.1.5.chr12 231377473 1e-107
CaES2744 Pepper.v.1.5.chr12 231521883 1e-113
CaES1691 Pepper.v.1.5.chr12 231621702 2e-34
CaES2480 Pepper.v.1.5.chr12 231671141 7e-49
CaES0449 Pepper.v.1.5.chr12 231709889 6e-91
CaES3994 Pepper.v.1.5.chr12 231721848 1e-107
CaES5500 Pepper.v.1.5.chr12 231902905 3e-84
CaES5238 Pepper.v.1.5.chr12 231936777 1e-125
CaES0073 Pepper.v.1.5.chr12 232169391 5e-70
CaES2172 Pepper.v.1.5.chr12 232417777 1e-139
CaES2265 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr12 232457057 1e-120
CaES3312 Pepper.v.1.5.chr12 232523099 4e-92
CaES4583 Pepper.v.1.5.chr12 232529476 1e-134
CaES2629 Pepper.v.1.5.chr12 232532141 1e-115
CaES2306 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr12 232536219 1e-54
CaES3035 Pepper.v.1.5.chr12 232548346 1e-117
CaES4461 Pepper.v.1.5.chr12 232567184 1e-149
CaES4312 Pepper.v.1.5.chr12 232568347 1e-143
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384

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