Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0048 Pepper.v.1.5.chr12 222418925 3e-98
CaES3008 Pepper.v.1.5.chr12 222522505 1e-138
CaES1545 Pepper.v.1.5.chr12 223122487 1e-122
CaES4466 Pepper.v.1.5.chr12 223188827 1e-102
CaES5234 Pepper.v.1.5.chr12 223203574 3e-69
CaES3256 Pepper.v.1.5.chr12 223288463 2e-95
CaES0236 Pepper.v.1.5.chr12 223416666 1e-130
CaES3750 Pepper.v.1.5.chr12 223425949 1e-110
CaES2137 Pepper.v.1.5.chr12 223515736 1e-123
CaES1008 Pepper.v.1.5.chr12 223553407 7e-52
CaES3715 Pepper.v.1.5.chr12 223932220 5e-75
CaES3269 Pepper.v.1.5.chr12 224353946 6e-99
CaES3112 Pepper.v.1.5.chr12 224354269 2e-84
CaES2112 Pepper.v.1.5.chr12 224685619 1e-109
CaES3485 Pepper.v.1.5.chr12 224723740 1e-124
CaES2365 Pepper.v.1.5.chr12 224735846 1e-137
CaES1903 Pepper.v.1.5.chr12 224786527 1e-124
CaES1889 Pepper.v.1.5.chr12 224816678 3e-51
CaES4847 Pepper.v.1.5.chr12 224848296 1e-125
CaES0387 Pepper.v.1.5.chr12 224929565 2e-94
CaES4224 Pepper.v.1.5.chr12 225095112 1e-131
CaES2915 Pepper.v.1.5.chr12 225239095 7e-60
CaES1168 Pepper.v.1.5.chr12 225614284 1e-153
CaES2326 Pepper.v.1.5.chr12 225745287 1e-103
CaES0691 Pepper.v.1.5.chr12 226054187 1e-101
CaES2832 Pepper.v.1.5.chr12 226703238 2e-28
CaES2758 Pepper.v.1.5.chr12 227086514 1e-107
CaES3488 Pepper.v.1.5.chr12 227569755 1e-145
CaES3318 Pepper.v.1.5.chr12 228079009 1e-33
CaES4891 Pepper.v.1.5.chr12 228079274 2e-70
CaES3976 Pepper.v.1.5.chr12 228094031 5e-62
CaES0415 Pepper.v.1.5.chr12 228152324 1e-113
CaES1690 Pepper.v.1.5.chr12 228459754 1e-101
CaES4289 Pepper.v.1.5.chr12 228492292 1e-119
CaES4617 Pepper.v.1.5.chr12 228506465 1e-124
CaES3672 Pepper.v.1.5.chr12 228618724 3e-92
CaES4217 Pepper.v.1.5.chr12 228668294 1e-144
CaES1001 Pepper.v.1.5.chr12 228737179 3e-94
CaES4248 Pepper.v.1.5.chr12 228762184 1e-157
CaES1789 Pepper.v.1.5.chr12 228776621 2e-86
CaES0876 Pepper.v.1.5.chr12 228871183 9e-60
CaES1566 Pepper.v.1.5.chr12 228877638 4e-44
CaES1895 Pepper.v.1.5.chr12 228955770 6e-36
CaES4539 Pepper.v.1.5.chr12 229007782 2e-92
CaES2145 Pepper.v.1.5.chr12 229064029 2e-81
CaES3306 Pepper.v.1.5.chr12 229092129 7e-80
CaES5222 Pepper.v.1.5.chr12 229512108 1e-76
CaES4442 Pepper.v.1.5.chr12 229581734 1e-66
CaES2290 Pepper.v.1.5.chr12 229638880 1e-100
CaES0230 Pepper.v.1.5.chr12 229717585 3e-96
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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