Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4486 Pepper.v.1.5.chr12 208479409 1e-135
CaES4511 Pepper.v.1.5.chr12 1667264 1e-113
CaES4522 Pepper.v.1.5.chr12 20899262 3e-91
CaES4527 Pepper.v.1.5.chr12 27977282 1e-147
CaES4539 Pepper.v.1.5.chr12 229007782 2e-92
CaES4575 Pepper.v.1.5.chr12 135621822 1e-135
CaES4582 Pepper.v.1.5.chr12 35095998 2e-99
CaES4583 Pepper.v.1.5.chr12 232529476 1e-134
CaES4591 Pepper.v.1.5.chr12 8111217 1e-110
CaES4594 Pepper.v.1.5.chr12 142202283 4e-95
CaES4598 Pepper.v.1.5.chr12 166537 9e-53
CaES4600 Pepper.v.1.5.chr12 126442222 1e-124
CaES4602 Pepper.v.1.5.chr12 6938074 1e-122
CaES4612 Pepper.v.1.5.chr12 193840409 1e-112
CaES4617 Pepper.v.1.5.chr12 228506465 1e-124
CaES4654 Pepper.v.1.5.chr12 39714572 8e-93
CaES4669 Pepper.v.1.5.chr12 231320739 1e-116
CaES4691 Pepper.v.1.5.chr12 32414186 1e-159
CaES4704 Pepper.v.1.5.chr12 162657201 9e-49
CaES4707 Pepper.v.1.5.chr12 203484251 1e-125
CaES4711 Pepper.v.1.5.chr12 39714572 2e-76
CaES4730 Pepper.v.1.5.chr12 230104924 1e-126
CaES4765 Pepper.v.1.5.chr12 90410333 2e-51
CaES4770 Pepper.v.1.5.chr12 1152585 1e-105
CaES4789 Pepper.v.1.5.chr12 32237306 4e-21
CaES4795 Pepper.v.1.5.chr12 230858848 5e-84
CaES4807 Pepper.v.1.5.chr12 189327374 1e-138
CaES4847 Pepper.v.1.5.chr12 224848296 1e-125
CaES4857 Pepper.v.1.5.chr12 2791808 7e-30
CaES4872 Pepper.v.1.5.chr12 230343656 1e-100
CaES4891 Pepper.v.1.5.chr12 228079274 2e-70
CaES4894 Pepper.v.1.5.chr12 127691275 1e-131
CaES4926 Pepper.v.1.5.chr12 231296214 1e-140
CaES4943 Pepper.v.1.5.chr12 63747057 1e-112
CaES4971 Pepper.v.1.5.chr12 4085351 1e-117
CaES4979 Pepper.v.1.5.chr12 219995466 5e-78
CaES4980 Pepper.v.1.5.chr12 10715861 3e-84
CaES4987 Pepper.v.1.5.chr12 203222877 1e-103
CaES4999 Pepper.v.1.5.chr12 15692735 1e-99
CaES5019 Pepper.v.1.5.chr12 1843542 4e-53
CaES5028 Pepper.v.1.5.chr12 221862651 2e-80
CaES5030 Pepper.v.1.5.chr12 67442209 1e-100
CaES5045 Pepper.v.1.5.chr12 5958194 1e-125
CaES5101 Pepper.v.1.5.chr12 206982097 1e-108
CaES5107 Pepper.v.1.5.chr12 131885083 1e-124
CaES5116 Pepper.v.1.5.chr12 230579243 9e-81
CaES5149 Pepper.v.1.5.chr12 194802588 2e-25
CaES5162 Pepper.v.1.5.chr12 13481157 7e-56
CaES5198 Pepper.v.1.5.chr12 197442194 1e-119
CaES5213 Pepper.v.1.5.chr12 125623929 1e-124
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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