Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3718 Pepper.v.1.5.chr12 9078476 1e-122
CaES3739 Pepper.v.1.5.chr12 124925125 4e-96
CaES3745 Pepper.v.1.5.chr12 18304452 1e-124
CaES3750 Pepper.v.1.5.chr12 223425949 1e-110
CaES3811 Pepper.v.1.5.chr12 13725216 1e-125
CaES3816 Pepper.v.1.5.chr12 166386034 1e-140
CaES3819 Pepper.v.1.5.chr12 15007176 1e-104
CaES3822 Pepper.v.1.5.chr12 212924007 1e-30
CaES3828 Pepper.v.1.5.chr12 17774327 2e-36
CaES3840 Pepper.v.1.5.chr12 213506985 3e-81
CaES3844 Pepper.v.1.5.chr12 181938974 1e-156
CaES3852 Pepper.v.1.5.chr12 212370661 6e-30
CaES3858 Pepper.v.1.5.chr12 196843837 1e-110
CaES3859 Pepper.v.1.5.chr12 31840887 2e-81
CaES3865 Pepper.v.1.5.chr12 132085290 1e-140
CaES3873 Pepper.v.1.5.chr12 41020776 1e-111
CaES3881 Pepper.v.1.5.chr12 1727512 9e-84
CaES3884 Pepper.v.1.5.chr12 124078496 1e-124
CaES3891 Pepper.v.1.5.chr12 207920274 6e-26
CaES3917 Pepper.v.1.5.chr12 32409510 1e-95
CaES3933 Pepper.v.1.5.chr12 12163992 5e-27
CaES3940 Pepper.v.1.5.chr12 9121786 4e-96
CaES3955 Pepper.v.1.5.chr12 230856407 1e-117
CaES3961 Pepper.v.1.5.chr12 192745117 2e-92
CaES3976 Pepper.v.1.5.chr12 228094031 5e-62
CaES3994 Pepper.v.1.5.chr12 231721848 1e-107
CaES4002 Pepper.v.1.5.chr12 87760669 1e-130
CaES4053 Pepper.v.1.5.chr12 46174905 1e-133
CaES4057 Pepper.v.1.5.chr12 204110304 8e-28
CaES4105 Pepper.v.1.5.chr12 105040579 1e-114
CaES4107 Pepper.v.1.5.chr12 179489052 6e-83
CaES4115 Pepper.v.1.5.chr12 194233462 7e-23
CaES4150 Pepper.v.1.5.chr12 152865869 1e-105
CaES4214 Pepper.v.1.5.chr12 31855935 1e-129
CaES4217 Pepper.v.1.5.chr12 228668294 1e-144
CaES4224 Pepper.v.1.5.chr12 225095112 1e-131
CaES4248 Pepper.v.1.5.chr12 228762184 1e-157
CaES4261 Pepper.v.1.5.chr12 230804191 1e-115
CaES4287 Pepper.v.1.5.chr12 198669375 2e-57
CaES4289 Pepper.v.1.5.chr12 228492292 1e-119
CaES4312 Pepper.v.1.5.chr12 232568347 1e-143
CaES4328 Pepper.v.1.5.chr12 197442721 1e-78
CaES4331 Pepper.v.1.5.chr12 87568806 4e-63
CaES4343 Pepper.v.1.5.chr12 217601796 1e-140
CaES4425 Pepper.v.1.5.chr12 7662866 4e-82
CaES4442 Pepper.v.1.5.chr12 229581734 1e-66
CaES4461 Pepper.v.1.5.chr12 232567184 1e-149
CaES4464 Pepper.v.1.5.chr12 104350390 1e-126
CaES4466 Pepper.v.1.5.chr12 223188827 1e-102
CaES4469 Pepper.v.1.5.chr12 230702387 1e-138
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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