Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3493 Pepper.v.1.5.chr12 172458322 1e-114
CaES0173 Pepper.v.1.5.chr12 174451961 1e-49
CaES0760 Pepper.v.1.5.chr12 175224384 1e-110
CaES0722 Pepper.v.1.5.chr12 175993516 1e-113
CaES0151 Pepper.v.1.5.chr12 177377650 1e-149
CaES3351 Pepper.v.1.5.chr12 177478629 2e-60
CaES1341 Pepper.v.1.5.chr12 178667787 1e-121
CaES4107 Pepper.v.1.5.chr12 179489052 6e-83
CaES0473 Pepper.v.1.5.chr12 181672246 1e-62
CaES1228 Pepper.v.1.5.chr12 181672464 3e-25
CaES1461 Pepper.v.1.5.chr12 181672530 4e-25
CaES3844 Pepper.v.1.5.chr12 181938974 1e-156
CaES1967 Pepper.v.1.5.chr12 183060483 2e-65
CaES3247 Pepper.v.1.5.chr12 186708946 1e-100
CaES4807 Pepper.v.1.5.chr12 189327374 1e-138
CaES5327 Pepper.v.1.5.chr12 189839817 1e-101
CaES2055 Pepper.v.1.5.chr12 189841510 1e-121
CaES0983 Pepper.v.1.5.chr12 190246099 1e-147
CaES2651 Pepper.v.1.5.chr12 190759126 1e-102
CaES3961 Pepper.v.1.5.chr12 192745117 2e-92
CaES3474 Pepper.v.1.5.chr12 193401350 1e-104
CaES4612 Pepper.v.1.5.chr12 193840409 1e-112
CaES4115 Pepper.v.1.5.chr12 194233462 7e-23
CaES3686 Pepper.v.1.5.chr12 194535149 1e-111
CaES5312 Pepper.v.1.5.chr12 194550731 1e-58
CaES0816 Pepper.v.1.5.chr12 194602043 2e-75
CaES5149 Pepper.v.1.5.chr12 194802588 2e-25
CaES1574 Pepper.v.1.5.chr12 195410084 1e-98
CaES3577 Pepper.v.1.5.chr12 195472468 1e-105
CaES0988 Pepper.v.1.5.chr12 195476325 1e-100
CaES5720 Pepper.v.1.5.chr12 196781796 2e-67
CaES3858 Pepper.v.1.5.chr12 196843837 1e-110
CaES5198 Pepper.v.1.5.chr12 197442194 1e-119
CaES4328 Pepper.v.1.5.chr12 197442721 1e-78
CaES5447 Pepper.v.1.5.chr12 198086258 1e-21
CaES3027 Pepper.v.1.5.chr12 198105581 2e-74
CaES2373 Pepper.v.1.5.chr12 198528347 2e-78
CaES4287 Pepper.v.1.5.chr12 198669375 2e-57
CaES1960 Pepper.v.1.5.chr12 198695336 1e-104
CaES2976 Pepper.v.1.5.chr12 198844610 1e-124
CaES2699 Pepper.v.1.5.chr12 200667690 1e-123
CaES4987 Pepper.v.1.5.chr12 203222877 1e-103
CaES5653 Pepper.v.1.5.chr12 203484122 1e-149
CaES4707 Pepper.v.1.5.chr12 203484251 1e-125
CaES1098 Pepper.v.1.5.chr12 203731604 8e-25
CaES4057 Pepper.v.1.5.chr12 204110304 8e-28
CaES0426 Pepper.v.1.5.chr12 204765446 1e-39
CaES5444 Pepper.v.1.5.chr12 204860738 4e-41
CaES2927 Pepper.v.1.5.chr12 206748379 2e-21
CaES1977 Pepper.v.1.5.chr12 206981709 1e-143
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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