Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2988 Pepper.v.1.5.chr12 32237541 1e-39
CaES3008 Pepper.v.1.5.chr12 222522505 1e-138
CaES3027 Pepper.v.1.5.chr12 198105581 2e-74
CaES3035 Pepper.v.1.5.chr12 232548346 1e-117
CaES3112 Pepper.v.1.5.chr12 224354269 2e-84
CaES3115 Pepper.v.1.5.chr12 7317648 4e-88
CaES3144 Pepper.v.1.5.chr12 3153108 5e-98
CaES3149 Pepper.v.1.5.chr12 213048968 1e-144
CaES3157 Pepper.v.1.5.chr12 64002334 1e-141
CaES3182 Pepper.v.1.5.chr12 17960399 6e-39
CaES3202 Pepper.v.1.5.chr12 13481157 9e-58
CaES3238 Pepper.v.1.5.chr12 32321178 1e-23
CaES3247 Pepper.v.1.5.chr12 186708946 1e-100
CaES3256 Pepper.v.1.5.chr12 223288463 2e-95
CaES3258 Pepper.v.1.5.chr12 58626985 1e-123
CaES3269 Pepper.v.1.5.chr12 224353946 6e-99
CaES3278 Pepper.v.1.5.chr12 35094075 2e-49
CaES3302 Pepper.v.1.5.chr12 36178956 3e-83
CaES3306 Pepper.v.1.5.chr12 229092129 7e-80
CaES3307 Pepper.v.1.5.chr12 222381022 2e-63
CaES3311 Pepper.v.1.5.chr12 220012861 2e-67
CaES3312 Pepper.v.1.5.chr12 232523099 4e-92
CaES3318 Pepper.v.1.5.chr12 228079009 1e-33
CaES3345 Pepper.v.1.5.chr12 123710432 7e-30
CaES3351 Pepper.v.1.5.chr12 177478629 2e-60
CaES3379 Pepper.v.1.5.chr12 204325 2e-98
CaES3417 Pepper.v.1.5.chr12 35702429 1e-140
CaES3460 Pepper.v.1.5.chr12 213321194 6e-35
CaES3474 Pepper.v.1.5.chr12 193401350 1e-104
CaES3475 Pepper.v.1.5.chr12 215609261 2e-71
CaES3479 Pepper.v.1.5.chr12 87684480 2e-93
CaES3485 Pepper.v.1.5.chr12 224723740 1e-124
CaES3488 Pepper.v.1.5.chr12 227569755 1e-145
CaES3493 Pepper.v.1.5.chr12 172458322 1e-114
CaES3499 Pepper.v.1.5.chr12 1027409 1e-147
CaES3502 Pepper.v.1.5.chr12 44365085 1e-72
CaES3509 Pepper.v.1.5.chr12 32493822 8e-35
CaES3513 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr12 24760997 1e-100
CaES3538 0.01 192 Pepper.v.1.5.chr12 81011917 1e-138
CaES3541 Pepper.v.1.5.chr12 104389511 1e-84
CaES3561 Pepper.v.1.5.chr12 35095554 1e-142
CaES3577 Pepper.v.1.5.chr12 195472468 1e-105
CaES3593 Pepper.v.1.5.chr12 32939390 4e-57
CaES3596 Pepper.v.1.5.chr12 214542679 1e-144
CaES3672 Pepper.v.1.5.chr12 228618724 3e-92
CaES3677 Pepper.v.1.5.chr12 214755059 1e-130
CaES3686 Pepper.v.1.5.chr12 194535149 1e-111
CaES3700 Pepper.v.1.5.chr12 840884 2e-67
CaES3701 Pepper.v.1.5.chr12 30765078 2e-46
CaES3715 Pepper.v.1.5.chr12 223932220 5e-75
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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