Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2172 Pepper.v.1.5.chr12 232417777 1e-139
CaES2216 Pepper.v.1.5.chr12 214043621 1e-133
CaES2228 Pepper.v.1.5.chr12 30038123 3e-89
CaES2265 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr12 232457057 1e-120
CaES2290 Pepper.v.1.5.chr12 229638880 1e-100
CaES2305 Pepper.v.1.5.chr12 64005851 6e-33
CaES2306 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr12 232536219 1e-54
CaES2309 Pepper.v.1.5.chr12 46794899 3e-91
CaES2326 Pepper.v.1.5.chr12 225745287 1e-103
CaES2344 Pepper.v.1.5.chr12 1753004 4e-81
CaES2365 Pepper.v.1.5.chr12 224735846 1e-137
CaES2373 Pepper.v.1.5.chr12 198528347 2e-78
CaES2375 Pepper.v.1.5.chr12 221537289 1e-131
CaES2386 Pepper.v.1.5.chr12 34953331 1e-179
CaES2397 Pepper.v.1.5.chr12 1232834 3e-62
CaES2404 Pepper.v.1.5.chr12 215636792 1e-137
CaES2441 Pepper.v.1.5.chr12 216617596 1e-101
CaES2480 Pepper.v.1.5.chr12 231671141 7e-49
CaES2483 Pepper.v.1.5.chr12 1239158 5e-25
CaES2486 Pepper.v.1.5.chr12 16189501 1e-103
CaES2528 Pepper.v.1.5.chr12 222209205 6e-27
CaES2538 Pepper.v.1.5.chr12 165601005 1e-132
CaES2542 Pepper.v.1.5.chr12 230594504 1e-112
CaES2568 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr12 224897294 3e-80
CaES2572 Pepper.v.1.5.chr12 5555676 1e-105
CaES2603 Pepper.v.1.5.chr12 6481849 1e-75
CaES2605 Pepper.v.1.5.chr12 13511659 1e-153
CaES2629 Pepper.v.1.5.chr12 232532141 1e-115
CaES2651 Pepper.v.1.5.chr12 190759126 1e-102
CaES2686 Pepper.v.1.5.chr12 207674013 7e-24
CaES2699 Pepper.v.1.5.chr12 200667690 1e-123
CaES2731 Pepper.v.1.5.chr12 37249659 1e-149
CaES2739 Pepper.v.1.5.chr12 83023240 2e-53
CaES2744 Pepper.v.1.5.chr12 231521883 1e-113
CaES2758 Pepper.v.1.5.chr12 227086514 1e-107
CaES2761 Pepper.v.1.5.chr12 4560534 5e-63
CaES2786 Pepper.v.1.5.chr12 132165131 1e-142
CaES2789 Pepper.v.1.5.chr12 222381937 6e-81
CaES2796 Pepper.v.1.5.chr12 36730766 1e-78
CaES2832 Pepper.v.1.5.chr12 226703238 2e-28
CaES2862 Pepper.v.1.5.chr12 213994701 1e-111
CaES2875 Pepper.v.1.5.chr12 38159153 1e-106
CaES2880 Pepper.v.1.5.chr12 38754646 1e-46
CaES2882 Pepper.v.1.5.chr12 8772967 6e-66
CaES2899 Pepper.v.1.5.chr12 46654021 1e-141
CaES2915 Pepper.v.1.5.chr12 225239095 7e-60
CaES2927 Pepper.v.1.5.chr12 206748379 2e-21
CaES2936 Pepper.v.1.5.chr12 146521979 1e-108
CaES2965 Pepper.v.1.5.chr12 58497912 2e-98
CaES2976 Pepper.v.1.5.chr12 198844610 1e-124
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


MarkerDB | Capsicum annuum