Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2603 Pepper.v.1.5.chr12 6481849 1e-75
CaES0711 Pepper.v.1.5.chr12 6937283 1e-133
CaES4602 Pepper.v.1.5.chr12 6938074 1e-122
CaES1172 Pepper.v.1.5.chr12 6976020 2e-81
CaES3115 Pepper.v.1.5.chr12 7317648 4e-88
CaES1182 Pepper.v.1.5.chr12 7320357 2e-94
CaES0650 Pepper.v.1.5.chr12 7608512 3e-65
CaES4425 Pepper.v.1.5.chr12 7662866 4e-82
CaES0113 Pepper.v.1.5.chr12 7955964 1e-103
CaES4591 Pepper.v.1.5.chr12 8111217 1e-110
CaES0938 Pepper.v.1.5.chr12 8111935 1e-122
CaES2882 Pepper.v.1.5.chr12 8772967 6e-66
CaES3718 Pepper.v.1.5.chr12 9078476 1e-122
CaES3940 Pepper.v.1.5.chr12 9121786 4e-96
CaES0690 Pepper.v.1.5.chr12 9131096 1e-112
CaES0030 Pepper.v.1.5.chr12 9636903 2e-21
CaES0309 Pepper.v.1.5.chr12 9878175 1e-125
CaES1887 Pepper.v.1.5.chr12 10320147 8e-60
CaES4980 Pepper.v.1.5.chr12 10715861 3e-84
CaES5251 Pepper.v.1.5.chr12 10718944 3e-27
CaES1163 Pepper.v.1.5.chr12 10743769 2e-22
CaES0577 Pepper.v.1.5.chr12 11156247 2e-38
CaES2146 Pepper.v.1.5.chr12 11646923 1e-132
CaES3933 Pepper.v.1.5.chr12 12163992 5e-27
CaES0334 Pepper.v.1.5.chr12 12498002 5e-82
CaES3202 Pepper.v.1.5.chr12 13481157 9e-58
CaES5162 Pepper.v.1.5.chr12 13481157 7e-56
CaES2605 Pepper.v.1.5.chr12 13511659 1e-153
CaES3811 Pepper.v.1.5.chr12 13725216 1e-125
CaES5672 Pepper.v.1.5.chr12 14183575 1e-118
CaES1856 Pepper.v.1.5.chr12 14659422 1e-140
CaES3819 Pepper.v.1.5.chr12 15007176 1e-104
CaES4999 Pepper.v.1.5.chr12 15692735 1e-99
CaES2486 Pepper.v.1.5.chr12 16189501 1e-103
CaES1264 Pepper.v.1.5.chr12 16189633 1e-115
CaES1254 Pepper.v.1.5.chr12 16386521 1e-144
CaES5688 Pepper.v.1.5.chr12 16715064 1e-145
CaES0320 Pepper.v.1.5.chr12 16986960 1e-127
CaES0757 Pepper.v.1.5.chr12 17154310 3e-81
CaES3828 Pepper.v.1.5.chr12 17774327 2e-36
CaES3182 Pepper.v.1.5.chr12 17960399 6e-39
CaES3745 Pepper.v.1.5.chr12 18304452 1e-124
CaES0019 Pepper.v.1.5.chr12 19791947 5e-57
CaES4522 Pepper.v.1.5.chr12 20899262 3e-91
CaES0203 Pepper.v.1.5.chr12 21023555 1e-141
CaES1130 Pepper.v.1.5.chr12 26444967 1e-112
CaES1427 Pepper.v.1.5.chr12 27495351 1e-115
CaES4527 Pepper.v.1.5.chr12 27977282 1e-147
CaES0931 Pepper.v.1.5.chr12 28929257 1e-127
CaES5476 Pepper.v.1.5.chr12 29978480 1e-61
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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