Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0757 Pepper.v.1.5.chr12 17154310 3e-81
CaES0760 Pepper.v.1.5.chr12 175224384 1e-110
CaES0776 Pepper.v.1.5.chr12 91844255 1e-85
CaES0787 Pepper.v.1.5.chr12 850273 2e-69
CaES0791 Pepper.v.1.5.chr12 169619209 3e-28
CaES0816 Pepper.v.1.5.chr12 194602043 2e-75
CaES0853 Pepper.v.1.5.chr12 215059266 1e-138
CaES0875 Pepper.v.1.5.chr12 3919060 1e-100
CaES0876 Pepper.v.1.5.chr12 228871183 9e-60
CaES0882 Pepper.v.1.5.chr12 214031143 1e-147
CaES0925 Pepper.v.1.5.chr12 116814911 3e-62
CaES0926 Pepper.v.1.5.chr12 134413905 8e-61
CaES0930 Pepper.v.1.5.chr12 4474520 1e-145
CaES0931 Pepper.v.1.5.chr12 28929257 1e-127
CaES0938 Pepper.v.1.5.chr12 8111935 1e-122
CaES0947 Pepper.v.1.5.chr12 222029963 1e-63
CaES0949 Pepper.v.1.5.chr12 214752792 3e-90
CaES0983 Pepper.v.1.5.chr12 190246099 1e-147
CaES0984 Pepper.v.1.5.chr12 221623235 6e-75
CaES0987 Pepper.v.1.5.chr12 160749391 5e-34
CaES0988 Pepper.v.1.5.chr12 195476325 1e-100
CaES1001 Pepper.v.1.5.chr12 228737179 3e-94
CaES1005 Pepper.v.1.5.chr12 152487790 2e-63
CaES1008 Pepper.v.1.5.chr12 223553407 7e-52
CaES1011 Pepper.v.1.5.chr12 134335402 1e-107
CaES1047 Pepper.v.1.5.chr12 53605817 1e-126
CaES1098 Pepper.v.1.5.chr12 203731604 8e-25
CaES1099 Pepper.v.1.5.chr12 214355134 1e-133
CaES1130 Pepper.v.1.5.chr12 26444967 1e-112
CaES1163 Pepper.v.1.5.chr12 10743769 2e-22
CaES1168 Pepper.v.1.5.chr12 225614284 1e-153
CaES1172 Pepper.v.1.5.chr12 6976020 2e-81
CaES1182 Pepper.v.1.5.chr12 7320357 2e-94
CaES1198 Pepper.v.1.5.chr12 34238423 1e-124
CaES1228 Pepper.v.1.5.chr12 181672464 3e-25
CaES1236 Pepper.v.1.5.chr12 213699674 1e-104
CaES1237 Pepper.v.1.5.chr12 230195977 1e-128
CaES1253 Pepper.v.1.5.chr12 124077703 1e-98
CaES1254 Pepper.v.1.5.chr12 16386521 1e-144
CaES1264 Pepper.v.1.5.chr12 16189633 1e-115
CaES1269 Pepper.v.1.5.chr12 212671761 1e-41
CaES1285 Pepper.v.1.5.chr12 155026368 9e-30
CaES1287 Pepper.v.1.5.chr12 1287337 4e-93
CaES1302 Pepper.v.1.5.chr12 162873 4e-82
CaES1335 Pepper.v.1.5.chr12 213599718 1e-139
CaES1341 Pepper.v.1.5.chr12 178667787 1e-121
CaES1369 Pepper.v.1.5.chr12 97482961 1e-108
CaES1387 Pepper.v.1.5.chr12 134346711 1e-80
CaES1388 Pepper.v.1.5.chr12 64007395 2e-93
CaES1420 Pepper.v.1.5.chr12 101081 1e-78
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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