Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES4616 0.237 191 Pepper.v.1.5.chr11 101354510 1e-127
CaES4640 Pepper.v.1.5.chr11 209749339 3e-66
CaES4648 Pepper.v.1.5.chr11 183469897 5e-42
CaES4668 Pepper.v.1.5.chr11 112154955 1e-149
CaES4777 Pepper.v.1.5.chr11 123778505 1e-179
CaES4860 Pepper.v.1.5.chr11 146593392 9e-44
CaES4887 Pepper.v.1.5.chr11 52126813 1e-30
CaES4888 Pepper.v.1.5.chr11 162501734 2e-47
CaES4896 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr11 213066052 1e-104
CaES4913 Pepper.v.1.5.chr11 241544201 1e-101
CaES4915 Pepper.v.1.5.chr11 5094693 1e-115
CaES4929 Pepper.v.1.5.chr11 1496648 1e-101
CaES4936 Pepper.v.1.5.chr11 243098305 1e-138
CaES4958 Pepper.v.1.5.chr11 8914294 4e-27
CaES4976 Pepper.v.1.5.chr11 225026764 1e-106
CaES4990 Pepper.v.1.5.chr11 244920365 1e-134
CaES5015 Pepper.v.1.5.chr11 16034852 1e-147
CaES5017 Pepper.v.1.5.chr11 89609573 1e-130
CaES5025 Pepper.v.1.5.chr11 14379320 1e-95
CaES5032 Pepper.v.1.5.chr11 174573164 1e-102
CaES5041 Pepper.v.1.5.chr11 9986215 1e-120
CaES5054 Pepper.v.1.5.chr11 221852310 1e-144
CaES5092 0.0 92 Pepper.v.1.5.chr11 158682319 1e-118
CaES5105 Pepper.v.1.5.chr11 136556269 1e-37
CaES5111 Pepper.v.1.5.chr11 49521622 2e-36
CaES5128 Pepper.v.1.5.chr11 1114484 1e-74
CaES5150 Pepper.v.1.5.chr11 229999056 2e-46
CaES5165 Pepper.v.1.5.chr11 141547400 1e-119
CaES5209 Pepper.v.1.5.chr11 30331766 4e-86
CaES5283 Pepper.v.1.5.chr11 7145377 1e-112
CaES5305 Pepper.v.1.5.chr11 45596902 2e-77
CaES5310 Pepper.v.1.5.chr11 230684979 6e-25
CaES5313 Pepper.v.1.5.chr11 243872476 1e-85
CaES5343 Pepper.v.1.5.chr11 25175034 1e-110
CaES5364 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr11 120280696 1e-136
CaES5371 Pepper.v.1.5.chr11 244608255 9e-56
CaES5415 Pepper.v.1.5.chr11 60603316 6e-56
CaES5423 Pepper.v.1.5.chr11 1541332 9e-78
CaES5426 Pepper.v.1.5.chr11 1158421 1e-114
CaES5449 Pepper.v.1.5.chr11 204768795 3e-66
CaES5492 Pepper.v.1.5.chr11 32998689 2e-95
CaES5496 Pepper.v.1.5.chr11 7100372 9e-74
CaES5547 Pepper.v.1.5.chr11 32561215 1e-121
CaES5549 Pepper.v.1.5.chr11 7364618 8e-29
CaES5597 Pepper.v.1.5.chr11 240874364 3e-84
CaES5607 Pepper.v.1.5.chr11 227643501 3e-36
CaES5617 Pepper.v.1.5.chr11 46952146 1e-83
CaES5647 0.0 189 Pepper.v.1.5.chr11 106821319 1e-143
CaES5664 Pepper.v.1.5.chr11 216512411 3e-45
CaES5690 Pepper.v.1.5.chr11 244177296 7e-31
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302

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