Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES5150 Pepper.v.1.5.chr11 229999056 2e-46
CaES3702 Pepper.v.1.5.chr11 230140720 1e-121
CaES0329 Pepper.v.1.5.chr11 230141135 8e-99
CaES5310 Pepper.v.1.5.chr11 230684979 6e-25
CaES0020 Pepper.v.1.5.chr11 230853636 1e-103
CaES3357 Pepper.v.1.5.chr11 232191178 2e-60
CaES3615 Pepper.v.1.5.chr11 232454015 1e-136
CaES1245 Pepper.v.1.5.chr11 235321463 1e-132
CaES2697 Pepper.v.1.5.chr11 235809955 1e-126
CaES0029 Pepper.v.1.5.chr11 236382396 8e-56
CaES0967 Pepper.v.1.5.chr11 236925193 1e-119
CaES0085 Pepper.v.1.5.chr11 237432755 1e-31
CaES2597 Pepper.v.1.5.chr11 237942896 8e-77
CaES1820 Pepper.v.1.5.chr11 239112278 5e-67
CaES0800 Pepper.v.1.5.chr11 239177135 1e-109
CaES1503 Pepper.v.1.5.chr11 239438011 5e-42
CaES1126 Pepper.v.1.5.chr11 239794088 6e-98
CaES2388 Pepper.v.1.5.chr11 240454585 2e-95
CaES2208 Pepper.v.1.5.chr11 240551476 3e-48
CaES5597 Pepper.v.1.5.chr11 240874364 3e-84
CaES4913 Pepper.v.1.5.chr11 241544201 1e-101
CaES2364 Pepper.v.1.5.chr11 241583282 1e-115
CaES2225 Pepper.v.1.5.chr11 241583483 1e-111
CaES0803 Pepper.v.1.5.chr11 241750998 5e-80
CaES3554 Pepper.v.1.5.chr11 241779779 1e-127
CaES1488 Pepper.v.1.5.chr11 241799761 3e-88
CaES1793 Pepper.v.1.5.chr11 241982343 2e-32
CaES2466 Pepper.v.1.5.chr11 242075379 5e-78
CaES1140 Pepper.v.1.5.chr11 242162369 7e-92
CaES0763 Pepper.v.1.5.chr11 242235090 4e-95
CaES4020 Pepper.v.1.5.chr11 242370155 2e-42
CaES1809 Pepper.v.1.5.chr11 242378487 1e-128
CaES0700 Pepper.v.1.5.chr11 242635870 1e-149
CaES2556 Pepper.v.1.5.chr11 243097893 5e-23
CaES4936 Pepper.v.1.5.chr11 243098305 1e-138
CaES5313 Pepper.v.1.5.chr11 243872476 1e-85
CaES4412 Pepper.v.1.5.chr11 244034551 1e-101
CaES3501 Pepper.v.1.5.chr11 244060960 1e-113
CaES3766 Pepper.v.1.5.chr11 244069507 1e-143
CaES5690 Pepper.v.1.5.chr11 244177296 7e-31
CaES3809 Pepper.v.1.5.chr11 244268533 1e-113
CaES1834 Pepper.v.1.5.chr11 244310001 1e-126
CaES2152 Pepper.v.1.5.chr11 244415873 1e-107
CaES1859 Pepper.v.1.5.chr11 244437356 1e-148
CaES1704 Pepper.v.1.5.chr11 244437560 1e-100
CaES1784 Pepper.v.1.5.chr11 244447676 3e-54
CaES5371 Pepper.v.1.5.chr11 244608255 9e-56
CaES3587 Pepper.v.1.5.chr11 244834617 4e-49
CaES4990 Pepper.v.1.5.chr11 244920365 1e-134
CaES1102 Pepper.v.1.5.chr11 244952172 1e-110
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302


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