Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3779 Pepper.v.1.5.chr11 24128933 1e-116
CaES3791 Pepper.v.1.5.chr11 169944736 6e-50
CaES3792 Pepper.v.1.5.chr11 221245634 8e-71
CaES3794 Pepper.v.1.5.chr11 49826326 1e-114
CaES3804 Pepper.v.1.5.chr11 14153317 1e-116
CaES3809 Pepper.v.1.5.chr11 244268533 1e-113
CaES3813 Pepper.v.1.5.chr11 170024515 5e-95
CaES3845 Pepper.v.1.5.chr11 14292537 9e-63
CaES3864 Pepper.v.1.5.chr11 142797047 1e-106
CaES3875 Pepper.v.1.5.chr11 4596818 1e-125
CaES3908 Pepper.v.1.5.chr11 175912659 1e-132
CaES3909 Pepper.v.1.5.chr11 245015027 6e-96
CaES3914 Pepper.v.1.5.chr11 150243926 6e-72
CaES3916 Pepper.v.1.5.chr11 155943380 6e-70
CaES3938 Pepper.v.1.5.chr11 128720704 1e-84
CaES3945 Pepper.v.1.5.chr11 709065 3e-79
CaES4001 Pepper.v.1.5.chr11 221849760 1e-131
CaES4020 Pepper.v.1.5.chr11 242370155 2e-42
CaES4037 Pepper.v.1.5.chr11 80306883 1e-87
CaES4047 Pepper.v.1.5.chr11 175656926 5e-96
CaES4054 Pepper.v.1.5.chr11 856643 1e-98
CaES4068 Pepper.v.1.5.chr11 52876646 2e-61
CaES4092 Pepper.v.1.5.chr11 171685493 1e-111
CaES4114 Pepper.v.1.5.chr11 2307514 1e-153
CaES4122 Pepper.v.1.5.chr11 73342341 1e-122
CaES4139 Pepper.v.1.5.chr11 99941580 1e-116
CaES4141 Pepper.v.1.5.chr11 3639954 1e-107
CaES4151 Pepper.v.1.5.chr11 203882316 1e-134
CaES4154 Pepper.v.1.5.chr11 20643676 1e-124
CaES4158 Pepper.v.1.5.chr11 24259635 1e-104
CaES4166 Pepper.v.1.5.chr11 183649577 1e-81
CaES4198 Pepper.v.1.5.chr11 60911960 3e-80
CaES4220 Pepper.v.1.5.chr11 38902013 1e-99
CaES4236 Pepper.v.1.5.chr11 33473585 2e-39
CaES4239 Pepper.v.1.5.chr11 26398685 8e-51
CaES4242 Pepper.v.1.5.chr11 206845098 2e-85
CaES4244 Pepper.v.1.5.chr11 1271627 1e-48
CaES4254 Pepper.v.1.5.chr11 50312363 1e-109
CaES4324 Pepper.v.1.5.chr11 2652931 1e-107
CaES4336 Pepper.v.1.5.chr11 21599624 1e-119
CaES4362 Pepper.v.1.5.chr11 27386684 4e-95
CaES4368 Pepper.v.1.5.chr11 156338916 5e-29
CaES4386 Pepper.v.1.5.chr11 50498243 6e-34
CaES4412 Pepper.v.1.5.chr11 244034551 1e-101
CaES4415 Pepper.v.1.5.chr11 13620073 1e-143
CaES4423 Pepper.v.1.5.chr11 119627018 1e-60
CaES4449 Pepper.v.1.5.chr11 42363277 1e-116
CaES4530 Pepper.v.1.5.chr11 502477 1e-73
CaES4556 Pepper.v.1.5.chr11 34495627 9e-92
CaES4613 0.0 25 Pepper.v.1.5.chr11 175157855 1e-103
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302


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