Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2640 Pepper.v.1.5.chr11 78819504 1e-101
CaES2674 Pepper.v.1.5.chr11 183468922 2e-49
CaES2697 Pepper.v.1.5.chr11 235809955 1e-126
CaES2795 Pepper.v.1.5.chr11 175806065 1e-150
CaES2814 Pepper.v.1.5.chr11 1172181 8e-54
CaES2824 Pepper.v.1.5.chr11 157446568 1e-159
CaES2868 Pepper.v.1.5.chr11 59378280 7e-29
CaES2890 Pepper.v.1.5.chr11 26402186 1e-94
CaES2901 Pepper.v.1.5.chr11 72764082 1e-124
CaES2910 Pepper.v.1.5.chr11 58635658 3e-91
CaES2924 Pepper.v.1.5.chr11 28301652 1e-143
CaES2933 Pepper.v.1.5.chr11 162511817 1e-137
CaES2947 Pepper.v.1.5.chr11 142101132 2e-80
CaES2950 Pepper.v.1.5.chr11 24197131 1e-107
CaES2968 Pepper.v.1.5.chr11 34500721 1e-120
CaES2977 Pepper.v.1.5.chr11 206843797 1e-138
CaES2996 Pepper.v.1.5.chr11 137089176 7e-61
CaES3001 Pepper.v.1.5.chr11 32383493 4e-84
CaES3118 Pepper.v.1.5.chr11 40132569 1e-118
CaES3126 Pepper.v.1.5.chr11 835852 1e-151
CaES3162 Pepper.v.1.5.chr11 224941096 2e-27
CaES3205 Pepper.v.1.5.chr11 210936100 1e-41
CaES3227 Pepper.v.1.5.chr11 1172928 1e-105
CaES3237 Pepper.v.1.5.chr11 8437195 1e-105
CaES3267 0.5 191 Pepper.v.1.5.chr11 71798861 1e-118
CaES3294 Pepper.v.1.5.chr11 187254087 4e-60
CaES3310 Pepper.v.1.5.chr11 115976111 6e-55
CaES3323 Pepper.v.1.5.chr11 228812628 4e-73
CaES3357 Pepper.v.1.5.chr11 232191178 2e-60
CaES3360 Pepper.v.1.5.chr11 773507 3e-98
CaES3441 Pepper.v.1.5.chr11 168217189 8e-37
CaES3456 Pepper.v.1.5.chr11 189654397 1e-136
CaES3462 Pepper.v.1.5.chr11 203995393 1e-102
CaES3501 Pepper.v.1.5.chr11 244060960 1e-113
CaES3542 Pepper.v.1.5.chr11 166156570 9e-79
CaES3554 Pepper.v.1.5.chr11 241779779 1e-127
CaES3559 Pepper.v.1.5.chr11 216634988 3e-76
CaES3587 Pepper.v.1.5.chr11 244834617 4e-49
CaES3594 Pepper.v.1.5.chr11 40861510 4e-58
CaES3615 Pepper.v.1.5.chr11 232454015 1e-136
CaES3630 Pepper.v.1.5.chr11 142934193 1e-119
CaES3655 Pepper.v.1.5.chr11 3019945 9e-50
CaES3675 Pepper.v.1.5.chr11 76152779 1e-155
CaES3702 Pepper.v.1.5.chr11 230140720 1e-121
CaES3706 Pepper.v.1.5.chr11 181227061 2e-82
CaES3725 Pepper.v.1.5.chr11 218396198 1e-116
CaES3729 Pepper.v.1.5.chr11 20857157 1e-110
CaES3737 Pepper.v.1.5.chr11 92636937 1e-135
CaES3738 Pepper.v.1.5.chr11 17805791 1e-123
CaES3766 Pepper.v.1.5.chr11 244069507 1e-143
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302


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