Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES1833 Pepper.v.1.5.chr11 1055876 3e-99
CaES1834 Pepper.v.1.5.chr11 244310001 1e-126
CaES1846 Pepper.v.1.5.chr11 13962692 1e-136
CaES1853 Pepper.v.1.5.chr11 123774438 5e-92
CaES1859 Pepper.v.1.5.chr11 244437356 1e-148
CaES1883 Pepper.v.1.5.chr11 60911470 1e-66
CaES1944 Pepper.v.1.5.chr11 5104477 2e-61
CaES2063 Pepper.v.1.5.chr11 42367720 1e-120
CaES2071 Pepper.v.1.5.chr11 179862567 7e-46
CaES2107 Pepper.v.1.5.chr11 216634781 1e-111
CaES2111 Pepper.v.1.5.chr11 30669521 1e-143
CaES2133 Pepper.v.1.5.chr11 223489677 1e-83
CaES2142 Pepper.v.1.5.chr11 207751498 1e-141
CaES2152 Pepper.v.1.5.chr11 244415873 1e-107
CaES2176 Pepper.v.1.5.chr11 46947065 1e-114
CaES2188 Pepper.v.1.5.chr11 161940689 2e-91
CaES2191 Pepper.v.1.5.chr11 5729198 1e-125
CaES2202 Pepper.v.1.5.chr11 6953259 1e-128
CaES2205 Pepper.v.1.5.chr11 206843781 6e-88
CaES2208 Pepper.v.1.5.chr11 240551476 3e-48
CaES2225 Pepper.v.1.5.chr11 241583483 1e-111
CaES2246 Pepper.v.1.5.chr11 229742172 1e-133
CaES2249 Pepper.v.1.5.chr11 189487205 4e-37
CaES2264 Pepper.v.1.5.chr11 181199035 1e-105
CaES2293 Pepper.v.1.5.chr11 43981548 1e-116
CaES2314 Pepper.v.1.5.chr11 14293966 6e-73
CaES2322 Pepper.v.1.5.chr11 211650206 1e-111
CaES2329 Pepper.v.1.5.chr11 159556242 1e-122
CaES2335 Pepper.v.1.5.chr11 91636518 3e-23
CaES2339 Pepper.v.1.5.chr11 187169422 6e-76
CaES2364 Pepper.v.1.5.chr11 241583282 1e-115
CaES2376 Pepper.v.1.5.chr11 90853234 1e-134
CaES2388 Pepper.v.1.5.chr11 240454585 2e-95
CaES2396 Pepper.v.1.5.chr11 171698726 1e-116
CaES2409 Pepper.v.1.5.chr11 175925036 8e-28
CaES2438 Pepper.v.1.5.chr11 3717173 1e-108
CaES2465 Pepper.v.1.5.chr11 24084396 6e-92
CaES2466 Pepper.v.1.5.chr11 242075379 5e-78
CaES2524 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr11 18429631 1e-85
CaES2556 Pepper.v.1.5.chr11 243097893 5e-23
CaES2558 Pepper.v.1.5.chr11 69033474 1e-140
CaES2575 Pepper.v.1.5.chr11 78582723 1e-118
CaES2576 0.0 173 Pepper.v.1.5.chr11 79290884 1e-157
CaES2582 Pepper.v.1.5.chr11 10148041 3e-72
CaES2584 0.11 189 Pepper.v.1.5.chr11 14681208 1e-61
CaES2586 Pepper.v.1.5.chr11 69607560 2e-99
CaES2597 Pepper.v.1.5.chr11 237942896 8e-77
CaES2598 Pepper.v.1.5.chr11 11288406 1e-128
CaES2616 Pepper.v.1.5.chr11 4967018 1e-136
CaES2632 Pepper.v.1.5.chr11 106869907 1e-129
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302

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