Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES1538 Pepper.v.1.5.chr11 42039155 2e-73
CaES4449 Pepper.v.1.5.chr11 42363277 1e-116
CaES2063 Pepper.v.1.5.chr11 42367720 1e-120
CaES0802 Pepper.v.1.5.chr11 43011409 4e-50
CaES2293 Pepper.v.1.5.chr11 43981548 1e-116
CaES0811 Pepper.v.1.5.chr11 44490486 1e-102
CaES5305 Pepper.v.1.5.chr11 45596902 2e-77
CaES1582 Pepper.v.1.5.chr11 46416632 1e-35
CaES2176 Pepper.v.1.5.chr11 46947065 1e-114
CaES5724 Pepper.v.1.5.chr11 46947976 1e-121
CaES5617 Pepper.v.1.5.chr11 46952146 1e-83
CaES0617 Pepper.v.1.5.chr11 48700832 2e-58
CaES5111 Pepper.v.1.5.chr11 49521622 2e-36
CaES3794 Pepper.v.1.5.chr11 49826326 1e-114
CaES4254 Pepper.v.1.5.chr11 50312363 1e-109
CaES4386 Pepper.v.1.5.chr11 50498243 6e-34
CaES4887 Pepper.v.1.5.chr11 52126813 1e-30
CaES4068 Pepper.v.1.5.chr11 52876646 2e-61
CaES2910 Pepper.v.1.5.chr11 58635658 3e-91
CaES2868 Pepper.v.1.5.chr11 59378280 7e-29
CaES0288 Pepper.v.1.5.chr11 60524926 1e-134
CaES5415 Pepper.v.1.5.chr11 60603316 6e-56
CaES1883 Pepper.v.1.5.chr11 60911470 1e-66
CaES4198 Pepper.v.1.5.chr11 60911960 3e-80
CaES0264 Pepper.v.1.5.chr11 62564532 1e-43
CaES0147 Pepper.v.1.5.chr11 64930501 1e-71
CaES1164 Pepper.v.1.5.chr11 66377829 2e-55
CaES0671 Pepper.v.1.5.chr11 68270463 3e-71
CaES2558 Pepper.v.1.5.chr11 69033474 1e-140
CaES2586 Pepper.v.1.5.chr11 69607560 2e-99
CaES1560 Pepper.v.1.5.chr11 71795675 2e-75
CaES3267 0.5 191 Pepper.v.1.5.chr11 71798861 1e-118
CaES2901 Pepper.v.1.5.chr11 72764082 1e-124
CaES4122 Pepper.v.1.5.chr11 73342341 1e-122
CaES3675 Pepper.v.1.5.chr11 76152779 1e-155
CaES2575 Pepper.v.1.5.chr11 78582723 1e-118
CaES2640 Pepper.v.1.5.chr11 78819504 1e-101
CaES2576 0.0 173 Pepper.v.1.5.chr11 79290884 1e-157
CaES4037 Pepper.v.1.5.chr11 80306883 1e-87
CaES1745 Pepper.v.1.5.chr11 84773657 7e-82
CaES1819 Pepper.v.1.5.chr11 85670836 4e-53
CaES5017 Pepper.v.1.5.chr11 89609573 1e-130
CaES2376 Pepper.v.1.5.chr11 90853234 1e-134
CaES2335 Pepper.v.1.5.chr11 91636518 3e-23
CaES3737 Pepper.v.1.5.chr11 92636937 1e-135
CaES4139 Pepper.v.1.5.chr11 99941580 1e-116
CaES4616 0.237 191 Pepper.v.1.5.chr11 101354510 1e-127
CaES5647 0.0 189 Pepper.v.1.5.chr11 106821319 1e-143
CaES2632 Pepper.v.1.5.chr11 106869907 1e-129
CaES4668 Pepper.v.1.5.chr11 112154955 1e-149
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302

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