Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES5496 Pepper.v.1.5.chr11 7100372 9e-74
CaES5283 Pepper.v.1.5.chr11 7145377 1e-112
CaES5549 Pepper.v.1.5.chr11 7364618 8e-29
CaES3237 Pepper.v.1.5.chr11 8437195 1e-105
CaES4958 Pepper.v.1.5.chr11 8914294 4e-27
CaES1373 Pepper.v.1.5.chr11 9714403 6e-93
CaES1491 Pepper.v.1.5.chr11 9831100 1e-53
CaES5041 Pepper.v.1.5.chr11 9986215 1e-120
CaES2582 Pepper.v.1.5.chr11 10148041 3e-72
CaES2598 Pepper.v.1.5.chr11 11288406 1e-128
CaES1607 Pepper.v.1.5.chr11 11793903 1e-144
CaES4415 Pepper.v.1.5.chr11 13620073 1e-143
CaES5691 Pepper.v.1.5.chr11 13960252 1e-100
CaES1846 Pepper.v.1.5.chr11 13962692 1e-136
CaES3804 Pepper.v.1.5.chr11 14153317 1e-116
CaES3845 Pepper.v.1.5.chr11 14292537 9e-63
CaES2314 Pepper.v.1.5.chr11 14293966 6e-73
CaES5025 Pepper.v.1.5.chr11 14379320 1e-95
CaES1280 Pepper.v.1.5.chr11 14779447 4e-21
CaES5015 Pepper.v.1.5.chr11 16034852 1e-147
CaES3738 Pepper.v.1.5.chr11 17805791 1e-123
CaES1257 Pepper.v.1.5.chr11 18378450 1e-151
CaES4154 Pepper.v.1.5.chr11 20643676 1e-124
CaES0014 Pepper.v.1.5.chr11 20833507 2e-81
CaES1759 Pepper.v.1.5.chr11 20848778 3e-79
CaES3729 Pepper.v.1.5.chr11 20857157 1e-110
CaES1452 Pepper.v.1.5.chr11 21163891 5e-68
CaES4336 Pepper.v.1.5.chr11 21599624 1e-119
CaES1259 Pepper.v.1.5.chr11 21695638 1e-151
CaES2465 Pepper.v.1.5.chr11 24084396 6e-92
CaES3779 Pepper.v.1.5.chr11 24128933 1e-116
CaES1083 Pepper.v.1.5.chr11 24164590 7e-76
CaES2950 Pepper.v.1.5.chr11 24197131 1e-107
CaES4158 Pepper.v.1.5.chr11 24259635 1e-104
CaES0840 Pepper.v.1.5.chr11 24296326 3e-29
CaES5343 Pepper.v.1.5.chr11 25175034 1e-110
CaES4239 Pepper.v.1.5.chr11 26398685 8e-51
CaES2890 Pepper.v.1.5.chr11 26402186 1e-94
CaES1565 Pepper.v.1.5.chr11 26869807 2e-30
CaES0977 Pepper.v.1.5.chr11 27350982 1e-124
CaES4362 Pepper.v.1.5.chr11 27386684 4e-95
CaES2924 Pepper.v.1.5.chr11 28301652 1e-143
CaES5209 Pepper.v.1.5.chr11 30331766 4e-86
CaES1539 Pepper.v.1.5.chr11 30435429 1e-105
CaES2111 Pepper.v.1.5.chr11 30669521 1e-143
CaES3001 Pepper.v.1.5.chr11 32383493 4e-84
CaES5547 Pepper.v.1.5.chr11 32561215 1e-121
CaES5492 Pepper.v.1.5.chr11 32998689 2e-95
CaES4236 Pepper.v.1.5.chr11 33473585 2e-39
CaES4556 Pepper.v.1.5.chr11 34495627 9e-92
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302

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