Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES1083 Pepper.v.1.5.chr11 24164590 7e-76
CaES1100 Pepper.v.1.5.chr11 486916 5e-27
CaES1102 Pepper.v.1.5.chr11 244952172 1e-110
CaES1105 Pepper.v.1.5.chr11 229951630 1e-104
CaES1116 Pepper.v.1.5.chr11 2263482 1e-136
CaES1126 Pepper.v.1.5.chr11 239794088 6e-98
CaES1140 Pepper.v.1.5.chr11 242162369 7e-92
CaES1164 Pepper.v.1.5.chr11 66377829 2e-55
CaES1173 Pepper.v.1.5.chr11 2382838 1e-145
CaES1194 Pepper.v.1.5.chr11 189653078 1e-73
CaES1195 Pepper.v.1.5.chr11 163401728 1e-148
CaES1245 Pepper.v.1.5.chr11 235321463 1e-132
CaES1247 Pepper.v.1.5.chr11 199317473 3e-59
CaES1257 Pepper.v.1.5.chr11 18378450 1e-151
CaES1259 Pepper.v.1.5.chr11 21695638 1e-151
CaES1262 Pepper.v.1.5.chr11 223974099 5e-74
CaES1280 Pepper.v.1.5.chr11 14779447 4e-21
CaES1316 Pepper.v.1.5.chr11 4732575 1e-137
CaES1333 Pepper.v.1.5.chr11 168189390 1e-119
CaES1373 Pepper.v.1.5.chr11 9714403 6e-93
CaES1404 Pepper.v.1.5.chr11 213542979 3e-72
CaES1417 Pepper.v.1.5.chr11 36348519 1e-142
CaES1432 Pepper.v.1.5.chr11 223571944 2e-89
CaES1437 Pepper.v.1.5.chr11 157447820 1e-21
CaES1452 Pepper.v.1.5.chr11 21163891 5e-68
CaES1462 Pepper.v.1.5.chr11 3077653 3e-55
CaES1488 Pepper.v.1.5.chr11 241799761 3e-88
CaES1491 Pepper.v.1.5.chr11 9831100 1e-53
CaES1503 Pepper.v.1.5.chr11 239438011 5e-42
CaES1524 Pepper.v.1.5.chr11 3570919 1e-54
CaES1538 Pepper.v.1.5.chr11 42039155 2e-73
CaES1539 Pepper.v.1.5.chr11 30435429 1e-105
CaES1560 Pepper.v.1.5.chr11 71795675 2e-75
CaES1565 Pepper.v.1.5.chr11 26869807 2e-30
CaES1582 Pepper.v.1.5.chr11 46416632 1e-35
CaES1588 Pepper.v.1.5.chr11 221631492 4e-90
CaES1596 Pepper.v.1.5.chr11 223630093 9e-66
CaES1598 Pepper.v.1.5.chr11 114372515 6e-83
CaES1606 Pepper.v.1.5.chr11 224916983 1e-110
CaES1607 Pepper.v.1.5.chr11 11793903 1e-144
CaES1704 Pepper.v.1.5.chr11 244437560 1e-100
CaES1745 Pepper.v.1.5.chr11 84773657 7e-82
CaES1759 Pepper.v.1.5.chr11 20848778 3e-79
CaES1766 Pepper.v.1.5.chr11 1584561 1e-127
CaES1784 Pepper.v.1.5.chr11 244447676 3e-54
CaES1793 Pepper.v.1.5.chr11 241982343 2e-32
CaES1809 Pepper.v.1.5.chr11 242378487 1e-128
CaES1819 Pepper.v.1.5.chr11 85670836 4e-53
CaES1820 Pepper.v.1.5.chr11 239112278 5e-67
CaES1826 Pepper.v.1.5.chr11 177384155 1e-128
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302

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