Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0746 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr10 118590300 2e-82
CaES3521 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr10 129470731 1e-127
CaES3198 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr10 226047157 2e-89
CaES0089 0.89 128 Pepper.v.1.5.chr10 81926696 1e-121
CaES4448 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr10 217977921 1e-103
CaES4787 0.01 192 Pepper.v.1.5.chr10 1769713 1e-107
CaES4597 0.457 192 Pepper.v.1.5.chr10 140326186 1e-111
CaES3158 Pepper.v.1.5.chr10 69710 8e-37
CaES1406 Pepper.v.1.5.chr10 71377 3e-86
CaES0888 Pepper.v.1.5.chr10 251433 1e-101
CaES1081 Pepper.v.1.5.chr10 267000 1e-153
CaES1147 Pepper.v.1.5.chr10 399791 2e-89
CaES1609 Pepper.v.1.5.chr10 422624 2e-83
CaES1757 Pepper.v.1.5.chr10 423981 1e-131
CaES3543 Pepper.v.1.5.chr10 537923 4e-47
CaES0117 Pepper.v.1.5.chr10 539217 5e-64
CaES3504 Pepper.v.1.5.chr10 786927 1e-130
CaES5605 Pepper.v.1.5.chr10 796270 3e-51
CaES0244 Pepper.v.1.5.chr10 1452665 5e-81
CaES3993 Pepper.v.1.5.chr10 1486341 1e-119
CaES2973 Pepper.v.1.5.chr10 1488192 1e-104
CaES1359 Pepper.v.1.5.chr10 1516860 5e-58
CaES2692 Pepper.v.1.5.chr10 1540730 1e-105
CaES1013 Pepper.v.1.5.chr10 1597785 2e-27
CaES2602 Pepper.v.1.5.chr10 1613502 6e-35
CaES5505 Pepper.v.1.5.chr10 1642320 5e-42
CaES2033 Pepper.v.1.5.chr10 1792463 1e-66
CaES5593 Pepper.v.1.5.chr10 1805594 5e-96
CaES3923 Pepper.v.1.5.chr10 2121705 4e-87
CaES0677 Pepper.v.1.5.chr10 2137294 1e-132
CaES4606 Pepper.v.1.5.chr10 2142575 6e-46
CaES2919 Pepper.v.1.5.chr10 2271636 1e-140
CaES2508 Pepper.v.1.5.chr10 2278498 5e-72
CaES0861 Pepper.v.1.5.chr10 2306525 2e-25
CaES2190 Pepper.v.1.5.chr10 2306527 7e-57
CaES3280 Pepper.v.1.5.chr10 2319835 1e-96
CaES0185 Pepper.v.1.5.chr10 2751608 1e-127
CaES0513 Pepper.v.1.5.chr10 3108714 2e-63
CaES1863 Pepper.v.1.5.chr10 3126062 8e-97
CaES1152 Pepper.v.1.5.chr10 3198091 1e-134
CaES1917 Pepper.v.1.5.chr10 3227327 1e-121
CaES3771 Pepper.v.1.5.chr10 3227694 1e-121
CaES0752 Pepper.v.1.5.chr10 3238193 1e-102
CaES3373 Pepper.v.1.5.chr10 3270102 5e-42
CaES1822 Pepper.v.1.5.chr10 3825133 9e-60
CaES3691 Pepper.v.1.5.chr10 3847923 1e-113
CaES1135 Pepper.v.1.5.chr10 3880580 1e-110
CaES4861 Pepper.v.1.5.chr10 3939820 8e-82
CaES5654 Pepper.v.1.5.chr10 4090085 1e-63
CaES1016 Pepper.v.1.5.chr10 4326766 7e-76
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390


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