Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0028 Pepper.v.1.5.chr10 150132570 4e-63
CaES0037 Pepper.v.1.5.chr10 217736446 1e-124
CaES0038 Pepper.v.1.5.chr10 225093963 4e-56
CaES0089 0.89 128 Pepper.v.1.5.chr10 81926696 1e-121
CaES0106 Pepper.v.1.5.chr10 222154033 1e-131
CaES0109 Pepper.v.1.5.chr10 108923284 1e-134
CaES0115 Pepper.v.1.5.chr10 10305579 1e-89
CaES0117 Pepper.v.1.5.chr10 539217 5e-64
CaES0138 Pepper.v.1.5.chr10 199530742 1e-115
CaES0140 Pepper.v.1.5.chr10 201797201 1e-41
CaES0185 Pepper.v.1.5.chr10 2751608 1e-127
CaES0192 Pepper.v.1.5.chr10 192287477 1e-110
CaES0240 Pepper.v.1.5.chr10 224958696 6e-37
CaES0244 Pepper.v.1.5.chr10 1452665 5e-81
CaES0273 Pepper.v.1.5.chr10 222663921 1e-119
CaES0282 Pepper.v.1.5.chr10 89080094 1e-42
CaES0307 Pepper.v.1.5.chr10 207700781 1e-118
CaES0342 Pepper.v.1.5.chr10 62140557 3e-30
CaES0354 Pepper.v.1.5.chr10 70483627 2e-31
CaES0364 Pepper.v.1.5.chr10 180278495 1e-112
CaES0374 Pepper.v.1.5.chr10 46496821 2e-88
CaES0378 Pepper.v.1.5.chr10 208034926 1e-115
CaES0434 Pepper.v.1.5.chr10 67495402 2e-62
CaES0444 Pepper.v.1.5.chr10 7780312 4e-66
CaES0475 Pepper.v.1.5.chr10 17746319 1e-123
CaES0506 Pepper.v.1.5.chr10 35530974 3e-94
CaES0513 Pepper.v.1.5.chr10 3108714 2e-63
CaES0525 Pepper.v.1.5.chr10 221689642 5e-28
CaES0584 Pepper.v.1.5.chr10 207100899 7e-93
CaES0609 Pepper.v.1.5.chr10 31279949 1e-122
CaES0611 Pepper.v.1.5.chr10 10411279 7e-64
CaES0638 Pepper.v.1.5.chr10 141530528 8e-78
CaES0651 Pepper.v.1.5.chr10 184875266 9e-83
CaES0652 Pepper.v.1.5.chr10 203890368 1e-104
CaES0659 Pepper.v.1.5.chr10 159548189 7e-24
CaES0670 Pepper.v.1.5.chr10 195310593 1e-144
CaES0677 Pepper.v.1.5.chr10 2137294 1e-132
CaES0704 Pepper.v.1.5.chr10 136014828 3e-23
CaES0746 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr10 118590300 2e-82
CaES0747 Pepper.v.1.5.chr10 213219810 1e-123
CaES0752 Pepper.v.1.5.chr10 3238193 1e-102
CaES0799 Pepper.v.1.5.chr10 7928317 1e-156
CaES0805 Pepper.v.1.5.chr10 222063177 1e-101
CaES0848 Pepper.v.1.5.chr10 100676497 3e-30
CaES0861 Pepper.v.1.5.chr10 2306525 2e-25
CaES0864 Pepper.v.1.5.chr10 152780875 1e-154
CaES0872 Pepper.v.1.5.chr10 10230367 1e-131
CaES0880 Pepper.v.1.5.chr10 216849571 1e-145
CaES0888 Pepper.v.1.5.chr10 251433 1e-101
CaES0891 Pepper.v.1.5.chr10 72980407 1e-137
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390


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