Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390

Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
Name Position*
CaES3707 Pepper.v.1.5.chr10 222567831 1e-139
CaES3236 Pepper.v.1.5.chr10 222607881 1e-85
CaES3563 Pepper.v.1.5.chr10 222663436 1e-148
CaES0273 Pepper.v.1.5.chr10 222663921 1e-119
CaES3028 Pepper.v.1.5.chr10 223638822 5e-97
CaES2509 Pepper.v.1.5.chr10 224054286 5e-78
CaES2533 Pepper.v.1.5.chr10 224721495 1e-104
CaES1919 Pepper.v.1.5.chr10 224786215 1e-105
CaES1928 Pepper.v.1.5.chr10 224796189 1e-124
CaES2219 Pepper.v.1.5.chr10 224828290 1e-138
CaES1109 Pepper.v.1.5.chr10 224870567 1e-136
CaES3571 Pepper.v.1.5.chr10 224932967 1e-126
CaES0240 Pepper.v.1.5.chr10 224958696 6e-37
CaES0038 Pepper.v.1.5.chr10 225093963 4e-56
CaES1227 Pepper.v.1.5.chr10 225252414 2e-91
CaES4855 Pepper.v.1.5.chr10 225252481 1e-118
CaES3599 Pepper.v.1.5.chr10 225314229 1e-98
CaES5579 Pepper.v.1.5.chr10 225367573 5e-36
CaES4518 Pepper.v.1.5.chr10 225472263 1e-30
CaES4657 Pepper.v.1.5.chr10 225472593 1e-134
CaES2232 Pepper.v.1.5.chr10 225616667 8e-81
CaES3178 Pepper.v.1.5.chr10 226050298 9e-36
CaES5585 Pepper.v.1.5.chr10 226215162 5e-93
CaES2985 Pepper.v.1.5.chr10 226228207 4e-22
CaES2109 Pepper.v.1.5.chr10 226271736 1e-115
CaES2960 Pepper.v.1.5.chr10 226336635 1e-147
CaES2403 Pepper.v.1.5.chr10 226499679 4e-76
CaES1175 Pepper.v.1.5.chr10 226507376 2e-36
CaES4458 Pepper.v.1.5.chr10 226539532 1e-88
CaES1605 Pepper.v.1.5.chr10 226682702 1e-101
CaES3697 Pepper.v.1.5.chr10 226822941 1e-99
CaES5527 Pepper.v.1.5.chr10 226866421 3e-97
CaES1276 Pepper.v.1.5.chr10 226871220 1e-119
CaES1966 Pepper.v.1.5.chr10 226982826 1e-146
CaES4206 Pepper.v.1.5.chr10 226983379 2e-93
CaES4994 Pepper.v.1.5.chr10 226984099 4e-99
CaES3057 Pepper.v.1.5.chr10 226984708 2e-69
CaES4225 Pepper.v.1.5.chr10 226997056 1e-104
CaES1328 Pepper.v.1.5.chr10 227000452 1e-115
CaES2775 Pepper.v.1.5.chr10 227075909 1e-124
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390

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