Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES4409 Pepper.v.1.5.chr10 150323375 1e-144
CaES4421 Pepper.v.1.5.chr10 173610594 4e-80
CaES4448 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr10 217977921 1e-103
CaES4454 Pepper.v.1.5.chr10 61943410 6e-60
CaES4455 Pepper.v.1.5.chr10 165402688 5e-79
CaES4457 Pepper.v.1.5.chr10 58855178 1e-125
CaES4458 Pepper.v.1.5.chr10 226539532 1e-88
CaES4483 Pepper.v.1.5.chr10 33895496 1e-108
CaES4488 Pepper.v.1.5.chr10 42852751 1e-114
CaES4508 Pepper.v.1.5.chr10 218503779 5e-94
CaES4518 Pepper.v.1.5.chr10 225472263 1e-30
CaES4531 Pepper.v.1.5.chr10 146951942 1e-126
CaES4535 Pepper.v.1.5.chr10 172809394 1e-103
CaES4541 Pepper.v.1.5.chr10 187932646 1e-140
CaES4550 Pepper.v.1.5.chr10 6186071 2e-85
CaES4587 Pepper.v.1.5.chr10 169514390 6e-68
CaES4597 0.457 192 Pepper.v.1.5.chr10 140326186 1e-111
CaES4601 Pepper.v.1.5.chr10 135472454 2e-92
CaES4606 Pepper.v.1.5.chr10 2142575 6e-46
CaES4620 Pepper.v.1.5.chr10 222306827 1e-141
CaES4650 Pepper.v.1.5.chr10 216553922 1e-126
CaES4657 Pepper.v.1.5.chr10 225472593 1e-134
CaES4660 Pepper.v.1.5.chr10 200383330 1e-137
CaES4692 Pepper.v.1.5.chr10 11227130 2e-52
CaES4694 Pepper.v.1.5.chr10 74902039 2e-40
CaES4714 Pepper.v.1.5.chr10 60610085 1e-138
CaES4787 0.01 192 Pepper.v.1.5.chr10 1769713 1e-107
CaES4800 Pepper.v.1.5.chr10 138308579 1e-138
CaES4802 Pepper.v.1.5.chr10 216814454 1e-115
CaES4809 Pepper.v.1.5.chr10 144484195 1e-138
CaES4814 Pepper.v.1.5.chr10 114093817 9e-45
CaES4820 Pepper.v.1.5.chr10 77964740 2e-80
CaES4855 Pepper.v.1.5.chr10 225252481 1e-118
CaES4861 Pepper.v.1.5.chr10 3939820 8e-82
CaES4862 Pepper.v.1.5.chr10 205434981 4e-54
CaES4892 Pepper.v.1.5.chr10 86793024 1e-133
CaES4954 Pepper.v.1.5.chr10 6803540 1e-134
CaES4966 Pepper.v.1.5.chr10 181755414 1e-134
CaES4973 Pepper.v.1.5.chr10 178681233 1e-161
CaES4984 Pepper.v.1.5.chr10 97753410 2e-51
CaES4991 Pepper.v.1.5.chr10 221361220 1e-145
CaES4994 Pepper.v.1.5.chr10 226984099 4e-99
CaES5035 Pepper.v.1.5.chr10 164074008 1e-144
CaES5053 Pepper.v.1.5.chr10 139438301 5e-75
CaES5059 Pepper.v.1.5.chr10 115670741 1e-109
CaES5078 Pepper.v.1.5.chr10 195806225 1e-125
CaES5104 Pepper.v.1.5.chr10 95912042 7e-88
CaES5113 Pepper.v.1.5.chr10 173793017 6e-86
CaES5125 Pepper.v.1.5.chr10 22376352 1e-40
CaES5131 Pepper.v.1.5.chr10 210161883 4e-33
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390

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