Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3611 Pepper.v.1.5.chr10 19860485 1e-122
CaES3622 Pepper.v.1.5.chr10 191408991 1e-116
CaES3633 Pepper.v.1.5.chr10 217565376 4e-83
CaES3634 Pepper.v.1.5.chr10 8836192 4e-93
CaES3654 Pepper.v.1.5.chr10 215710120 1e-64
CaES3669 Pepper.v.1.5.chr10 180968421 1e-106
CaES3691 Pepper.v.1.5.chr10 3847923 1e-113
CaES3697 Pepper.v.1.5.chr10 226822941 1e-99
CaES3703 Pepper.v.1.5.chr10 114093733 6e-34
CaES3707 Pepper.v.1.5.chr10 222567831 1e-139
CaES3736 Pepper.v.1.5.chr10 87135343 1e-127
CaES3770 Pepper.v.1.5.chr10 126861874 2e-45
CaES3771 Pepper.v.1.5.chr10 3227694 1e-121
CaES3782 Pepper.v.1.5.chr10 195791117 3e-96
CaES3786 Pepper.v.1.5.chr10 151105845 1e-109
CaES3796 Pepper.v.1.5.chr10 38247912 1e-110
CaES3846 Pepper.v.1.5.chr10 164661766 1e-158
CaES3851 Pepper.v.1.5.chr10 222137644 1e-132
CaES3918 Pepper.v.1.5.chr10 35512870 1e-112
CaES3923 Pepper.v.1.5.chr10 2121705 4e-87
CaES3930 Pepper.v.1.5.chr10 98767047 1e-138
CaES3932 Pepper.v.1.5.chr10 18265824 1e-109
CaES3936 Pepper.v.1.5.chr10 181575410 1e-97
CaES3975 Pepper.v.1.5.chr10 193354666 5e-64
CaES3993 Pepper.v.1.5.chr10 1486341 1e-119
CaES3996 Pepper.v.1.5.chr10 10349931 1e-121
CaES4058 Pepper.v.1.5.chr10 75589979 9e-50
CaES4062 Pepper.v.1.5.chr10 111025024 1e-145
CaES4077 Pepper.v.1.5.chr10 8864860 3e-76
CaES4088 Pepper.v.1.5.chr10 27153782 5e-78
CaES4128 Pepper.v.1.5.chr10 188131094 7e-59
CaES4173 Pepper.v.1.5.chr10 60024624 1e-105
CaES4183 Pepper.v.1.5.chr10 156164303 8e-65
CaES4189 Pepper.v.1.5.chr10 217791544 3e-80
CaES4201 Pepper.v.1.5.chr10 38204727 1e-128
CaES4206 Pepper.v.1.5.chr10 226983379 2e-93
CaES4225 Pepper.v.1.5.chr10 226997056 1e-104
CaES4226 Pepper.v.1.5.chr10 152049567 3e-25
CaES4240 Pepper.v.1.5.chr10 216851394 6e-70
CaES4250 Pepper.v.1.5.chr10 14889376 1e-104
CaES4275 Pepper.v.1.5.chr10 219655434 1e-157
CaES4281 Pepper.v.1.5.chr10 96074583 1e-105
CaES4291 Pepper.v.1.5.chr10 88921243 2e-43
CaES4297 Pepper.v.1.5.chr10 205412371 9e-68
CaES4304 Pepper.v.1.5.chr10 222566213 1e-104
CaES4326 Pepper.v.1.5.chr10 82342438 1e-69
CaES4347 Pepper.v.1.5.chr10 211517589 1e-120
CaES4367 Pepper.v.1.5.chr10 200987757 1e-127
CaES4379 Pepper.v.1.5.chr10 219501415 6e-75
CaES4395 Pepper.v.1.5.chr10 87134245 1e-142
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390


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