Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3099 Pepper.v.1.5.chr10 174161595 6e-95
CaES3104 Pepper.v.1.5.chr10 218928637 3e-32
CaES3107 Pepper.v.1.5.chr10 140097013 6e-91
CaES3131 Pepper.v.1.5.chr10 29449762 1e-118
CaES3134 Pepper.v.1.5.chr10 110426171 2e-62
CaES3147 Pepper.v.1.5.chr10 29384399 3e-97
CaES3150 Pepper.v.1.5.chr10 187591874 1e-119
CaES3153 Pepper.v.1.5.chr10 217008921 1e-130
CaES3158 Pepper.v.1.5.chr10 69710 8e-37
CaES3169 Pepper.v.1.5.chr10 66045534 7e-66
CaES3173 Pepper.v.1.5.chr10 79457788 4e-75
CaES3178 Pepper.v.1.5.chr10 226050298 9e-36
CaES3179 Pepper.v.1.5.chr10 6633745 1e-58
CaES3181 Pepper.v.1.5.chr10 6633745 5e-58
CaES3184 Pepper.v.1.5.chr10 6633745 2e-58
CaES3187 Pepper.v.1.5.chr10 16413339 3e-57
CaES3190 Pepper.v.1.5.chr10 16413206 6e-83
CaES3191 Pepper.v.1.5.chr10 16413095 2e-81
CaES3193 Pepper.v.1.5.chr10 6444387 2e-29
CaES3195 Pepper.v.1.5.chr10 6444387 2e-29
CaES3196 Pepper.v.1.5.chr10 16413095 1e-88
CaES3198 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr10 226047157 2e-89
CaES3199 Pepper.v.1.5.chr10 16413413 4e-62
CaES3214 Pepper.v.1.5.chr10 55923995 0.0
CaES3230 Pepper.v.1.5.chr10 121932753 2e-30
CaES3236 Pepper.v.1.5.chr10 222607881 1e-85
CaES3250 Pepper.v.1.5.chr10 134927413 1e-60
CaES3255 Pepper.v.1.5.chr10 169848279 1e-103
CaES3271 Pepper.v.1.5.chr10 185890255 5e-43
CaES3280 Pepper.v.1.5.chr10 2319835 1e-96
CaES3285 Pepper.v.1.5.chr10 11169658 1e-109
CaES3373 Pepper.v.1.5.chr10 3270102 5e-42
CaES3423 Pepper.v.1.5.chr10 60605481 7e-87
CaES3457 Pepper.v.1.5.chr10 114093751 6e-74
CaES3471 Pepper.v.1.5.chr10 164817068 2e-88
CaES3477 Pepper.v.1.5.chr10 219227948 1e-130
CaES3489 Pepper.v.1.5.chr10 46373740 1e-25
CaES3504 Pepper.v.1.5.chr10 786927 1e-130
CaES3507 Pepper.v.1.5.chr10 173610528 1e-78
CaES3518 Pepper.v.1.5.chr10 74013296 3e-51
CaES3521 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr10 129470731 1e-127
CaES3523 Pepper.v.1.5.chr10 31905889 1e-125
CaES3543 Pepper.v.1.5.chr10 537923 4e-47
CaES3545 Pepper.v.1.5.chr10 40150989 1e-120
CaES3563 Pepper.v.1.5.chr10 222663436 1e-148
CaES3571 Pepper.v.1.5.chr10 224932967 1e-126
CaES3584 Pepper.v.1.5.chr10 205319614 1e-110
CaES3586 Pepper.v.1.5.chr10 95696452 1e-115
CaES3592 Pepper.v.1.5.chr10 169972241 1e-128
CaES3599 Pepper.v.1.5.chr10 225314229 1e-98
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390


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