Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4800 Pepper.v.1.5.chr10 138308579 1e-138
CaES5053 Pepper.v.1.5.chr10 139438301 5e-75
CaES3107 Pepper.v.1.5.chr10 140097013 6e-91
CaES4597 0.457 192 Pepper.v.1.5.chr10 140326186 1e-111
CaES0638 Pepper.v.1.5.chr10 141530528 8e-78
CaES2138 Pepper.v.1.5.chr10 142444150 1e-140
CaES4809 Pepper.v.1.5.chr10 144484195 1e-138
CaES4531 Pepper.v.1.5.chr10 146951942 1e-126
CaES1025 Pepper.v.1.5.chr10 149675002 1e-85
CaES0028 Pepper.v.1.5.chr10 150132570 4e-63
CaES4409 Pepper.v.1.5.chr10 150323375 1e-144
CaES3786 Pepper.v.1.5.chr10 151105845 1e-109
CaES4226 Pepper.v.1.5.chr10 152049567 3e-25
CaES5600 Pepper.v.1.5.chr10 152605349 2e-42
CaES0864 Pepper.v.1.5.chr10 152780875 1e-154
CaES1924 Pepper.v.1.5.chr10 152942520 1e-112
CaES1467 Pepper.v.1.5.chr10 155371873 3e-26
CaES4183 Pepper.v.1.5.chr10 156164303 8e-65
CaES0659 Pepper.v.1.5.chr10 159548189 7e-24
CaES5564 Pepper.v.1.5.chr10 159548189 7e-52
CaES5035 Pepper.v.1.5.chr10 164074008 1e-144
CaES2990 Pepper.v.1.5.chr10 164446480 1e-90
CaES3846 Pepper.v.1.5.chr10 164661766 1e-158
CaES3471 Pepper.v.1.5.chr10 164817068 2e-88
CaES1142 Pepper.v.1.5.chr10 165023253 3e-86
CaES4455 Pepper.v.1.5.chr10 165402688 5e-79
CaES2987 Pepper.v.1.5.chr10 166107214 1e-107
CaES4587 Pepper.v.1.5.chr10 169514390 6e-68
CaES3255 Pepper.v.1.5.chr10 169848279 1e-103
CaES3592 Pepper.v.1.5.chr10 169972241 1e-128
CaES4535 Pepper.v.1.5.chr10 172809394 1e-103
CaES3507 Pepper.v.1.5.chr10 173610528 1e-78
CaES4421 Pepper.v.1.5.chr10 173610594 4e-80
CaES5113 Pepper.v.1.5.chr10 173793017 6e-86
CaES3099 Pepper.v.1.5.chr10 174161595 6e-95
CaES2958 Pepper.v.1.5.chr10 175178628 9e-53
CaES2765 Pepper.v.1.5.chr10 175212228 7e-34
CaES4973 Pepper.v.1.5.chr10 178681233 1e-161
CaES0364 Pepper.v.1.5.chr10 180278495 1e-112
CaES3669 Pepper.v.1.5.chr10 180968421 1e-106
CaES3936 Pepper.v.1.5.chr10 181575410 1e-97
CaES5727 Pepper.v.1.5.chr10 181575692 1e-119
CaES4966 Pepper.v.1.5.chr10 181755414 1e-134
CaES1983 Pepper.v.1.5.chr10 183936250 1e-149
CaES0651 Pepper.v.1.5.chr10 184875266 9e-83
CaES5217 Pepper.v.1.5.chr10 185688876 1e-105
CaES1777 Pepper.v.1.5.chr10 185818860 3e-39
CaES3271 Pepper.v.1.5.chr10 185890255 5e-43
CaES2906 Pepper.v.1.5.chr10 187225727 8e-39
CaES3150 Pepper.v.1.5.chr10 187591874 1e-119
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390


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