Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2317 Pepper.v.1.5.chr10 204816366 9e-89
CaES2345 Pepper.v.1.5.chr10 210198668 2e-48
CaES2352 Pepper.v.1.5.chr10 210340322 2e-54
CaES2355 Pepper.v.1.5.chr10 196419529 2e-27
CaES2357 Pepper.v.1.5.chr10 9041198 1e-125
CaES2398 Pepper.v.1.5.chr10 221642718 2e-84
CaES2403 Pepper.v.1.5.chr10 226499679 4e-76
CaES2432 Pepper.v.1.5.chr10 219704431 1e-100
CaES2433 Pepper.v.1.5.chr10 106260750 1e-103
CaES2508 Pepper.v.1.5.chr10 2278498 5e-72
CaES2509 Pepper.v.1.5.chr10 224054286 5e-78
CaES2525 Pepper.v.1.5.chr10 214436313 2e-73
CaES2533 Pepper.v.1.5.chr10 224721495 1e-104
CaES2566 Pepper.v.1.5.chr10 217867251 8e-30
CaES2567 Pepper.v.1.5.chr10 132631265 8e-98
CaES2570 Pepper.v.1.5.chr10 213160919 3e-96
CaES2602 Pepper.v.1.5.chr10 1613502 6e-35
CaES2608 Pepper.v.1.5.chr10 73759940 1e-101
CaES2626 Pepper.v.1.5.chr10 5342979 1e-147
CaES2647 Pepper.v.1.5.chr10 215710594 1e-101
CaES2671 Pepper.v.1.5.chr10 118156448 1e-109
CaES2688 Pepper.v.1.5.chr10 121353364 1e-113
CaES2691 Pepper.v.1.5.chr10 111948188 1e-102
CaES2692 Pepper.v.1.5.chr10 1540730 1e-105
CaES2729 Pepper.v.1.5.chr10 204252249 1e-155
CaES2752 Pepper.v.1.5.chr10 221302200 1e-105
CaES2765 Pepper.v.1.5.chr10 175212228 7e-34
CaES2775 Pepper.v.1.5.chr10 227075909 1e-124
CaES2802 Pepper.v.1.5.chr10 193961646 1e-134
CaES2819 Pepper.v.1.5.chr10 217899915 1e-114
CaES2830 Pepper.v.1.5.chr10 44377461 1e-33
CaES2837 Pepper.v.1.5.chr10 190237428 8e-57
CaES2847 Pepper.v.1.5.chr10 19676169 6e-75
CaES2873 Pepper.v.1.5.chr10 121353910 1e-145
CaES2906 Pepper.v.1.5.chr10 187225727 8e-39
CaES2919 Pepper.v.1.5.chr10 2271636 1e-140
CaES2958 Pepper.v.1.5.chr10 175178628 9e-53
CaES2960 Pepper.v.1.5.chr10 226336635 1e-147
CaES2973 Pepper.v.1.5.chr10 1488192 1e-104
CaES2974 Pepper.v.1.5.chr10 5869860 5e-50
CaES2985 Pepper.v.1.5.chr10 226228207 4e-22
CaES2987 Pepper.v.1.5.chr10 166107214 1e-107
CaES2990 Pepper.v.1.5.chr10 164446480 1e-90
CaES3013 Pepper.v.1.5.chr10 10580523 1e-134
CaES3028 Pepper.v.1.5.chr10 223638822 5e-97
CaES3030 Pepper.v.1.5.chr10 67486990 1e-115
CaES3038 Pepper.v.1.5.chr10 19601943 2e-66
CaES3050 Pepper.v.1.5.chr10 204924200 1e-147
CaES3057 Pepper.v.1.5.chr10 226984708 2e-69
CaES3076 Pepper.v.1.5.chr10 213986537 1e-118
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390

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