Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1620 Pepper.v.1.5.chr10 132631265 1e-108
CaES1679 Pepper.v.1.5.chr10 11013498 1e-141
CaES1697 Pepper.v.1.5.chr10 84445711 7e-66
CaES1701 Pepper.v.1.5.chr10 201291016 1e-109
CaES1705 Pepper.v.1.5.chr10 221247550 1e-113
CaES1715 Pepper.v.1.5.chr10 62901726 2e-96
CaES1716 Pepper.v.1.5.chr10 15810616 1e-122
CaES1723 Pepper.v.1.5.chr10 207104437 1e-120
CaES1726 Pepper.v.1.5.chr10 202931308 2e-57
CaES1727 Pepper.v.1.5.chr10 84445165 2e-80
CaES1734 Pepper.v.1.5.chr10 36030308 4e-21
CaES1742 Pepper.v.1.5.chr10 42834626 1e-64
CaES1757 Pepper.v.1.5.chr10 423981 1e-131
CaES1777 Pepper.v.1.5.chr10 185818860 3e-39
CaES1795 Pepper.v.1.5.chr10 207443030 2e-36
CaES1822 Pepper.v.1.5.chr10 3825133 9e-60
CaES1823 Pepper.v.1.5.chr10 196066604 1e-134
CaES1840 Pepper.v.1.5.chr10 74613761 1e-123
CaES1863 Pepper.v.1.5.chr10 3126062 8e-97
CaES1904 Pepper.v.1.5.chr10 49141963 2e-89
CaES1917 Pepper.v.1.5.chr10 3227327 1e-121
CaES1919 Pepper.v.1.5.chr10 224786215 1e-105
CaES1924 Pepper.v.1.5.chr10 152942520 1e-112
CaES1928 Pepper.v.1.5.chr10 224796189 1e-124
CaES1966 Pepper.v.1.5.chr10 226982826 1e-146
CaES1983 Pepper.v.1.5.chr10 183936250 1e-149
CaES2029 Pepper.v.1.5.chr10 187937433 5e-99
CaES2033 Pepper.v.1.5.chr10 1792463 1e-66
CaES2042 Pepper.v.1.5.chr10 221185651 1e-100
CaES2067 Pepper.v.1.5.chr10 55926913 1e-137
CaES2072 Pepper.v.1.5.chr10 18901461 4e-96
CaES2076 Pepper.v.1.5.chr10 10419093 2e-72
CaES2098 Pepper.v.1.5.chr10 126876906 6e-70
CaES2099 Pepper.v.1.5.chr10 126876920 2e-32
CaES2109 Pepper.v.1.5.chr10 226271736 1e-115
CaES2117 Pepper.v.1.5.chr10 7980304 1e-109
CaES2118 Pepper.v.1.5.chr10 133998601 4e-55
CaES2119 Pepper.v.1.5.chr10 37105682 2e-50
CaES2124 Pepper.v.1.5.chr10 219433657 6e-60
CaES2138 Pepper.v.1.5.chr10 142444150 1e-140
CaES2168 Pepper.v.1.5.chr10 67489036 1e-100
CaES2190 Pepper.v.1.5.chr10 2306527 7e-57
CaES2219 Pepper.v.1.5.chr10 224828290 1e-138
CaES2221 Pepper.v.1.5.chr10 8012529 4e-27
CaES2232 Pepper.v.1.5.chr10 225616667 8e-81
CaES2262 Pepper.v.1.5.chr10 96608196 1e-112
CaES2277 Pepper.v.1.5.chr10 44593404 1e-165
CaES2281 Pepper.v.1.5.chr10 121165874 1e-148
CaES2297 Pepper.v.1.5.chr10 82184686 1e-101
CaES2315 Pepper.v.1.5.chr10 78795202 6e-75
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390


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