Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES0927 Pepper.v.1.5.chr10 190235657 3e-84
CaES0932 Pepper.v.1.5.chr10 211533779 1e-122
CaES0955 Pepper.v.1.5.chr10 199751779 1e-122
CaES0966 Pepper.v.1.5.chr10 201552223 2e-88
CaES0982 Pepper.v.1.5.chr10 121788775 1e-107
CaES1013 Pepper.v.1.5.chr10 1597785 2e-27
CaES1016 Pepper.v.1.5.chr10 4326766 7e-76
CaES1025 Pepper.v.1.5.chr10 149675002 1e-85
CaES1046 Pepper.v.1.5.chr10 213217894 1e-128
CaES1058 Pepper.v.1.5.chr10 189014998 1e-116
CaES1064 Pepper.v.1.5.chr10 200892121 1e-77
CaES1069 Pepper.v.1.5.chr10 73182615 1e-122
CaES1075 Pepper.v.1.5.chr10 115656990 1e-129
CaES1076 Pepper.v.1.5.chr10 219568469 4e-93
CaES1081 Pepper.v.1.5.chr10 267000 1e-153
CaES1088 Pepper.v.1.5.chr10 8068479 3e-86
CaES1090 Pepper.v.1.5.chr10 208033168 2e-95
CaES1093 Pepper.v.1.5.chr10 85482757 1e-63
CaES1108 Pepper.v.1.5.chr10 188614370 1e-35
CaES1109 Pepper.v.1.5.chr10 224870567 1e-136
CaES1135 Pepper.v.1.5.chr10 3880580 1e-110
CaES1142 Pepper.v.1.5.chr10 165023253 3e-86
CaES1147 Pepper.v.1.5.chr10 399791 2e-89
CaES1152 Pepper.v.1.5.chr10 3198091 1e-134
CaES1155 Pepper.v.1.5.chr10 40148434 3e-84
CaES1158 Pepper.v.1.5.chr10 215700781 5e-66
CaES1175 Pepper.v.1.5.chr10 226507376 2e-36
CaES1202 Pepper.v.1.5.chr10 196288349 1e-133
CaES1203 Pepper.v.1.5.chr10 196295115 1e-130
CaES1227 Pepper.v.1.5.chr10 225252414 2e-91
CaES1239 Pepper.v.1.5.chr10 86770631 1e-111
CaES1276 Pepper.v.1.5.chr10 226871220 1e-119
CaES1313 Pepper.v.1.5.chr10 216298253 5e-70
CaES1327 Pepper.v.1.5.chr10 221738697 1e-135
CaES1328 Pepper.v.1.5.chr10 227000452 1e-115
CaES1329 Pepper.v.1.5.chr10 134927722 1e-43
CaES1353 Pepper.v.1.5.chr10 105733059 1e-106
CaES1359 Pepper.v.1.5.chr10 1516860 5e-58
CaES1406 Pepper.v.1.5.chr10 71377 3e-86
CaES1428 Pepper.v.1.5.chr10 46472477 1e-104
CaES1429 Pepper.v.1.5.chr10 213908389 1e-46
CaES1458 Pepper.v.1.5.chr10 85972104 4e-69
CaES1467 Pepper.v.1.5.chr10 155371873 3e-26
CaES1504 Pepper.v.1.5.chr10 62818060 2e-91
CaES1528 Pepper.v.1.5.chr10 216795075 3e-84
CaES1537 Pepper.v.1.5.chr10 221153360 1e-38
CaES1541 Pepper.v.1.5.chr10 96608556 1e-72
CaES1557 Pepper.v.1.5.chr10 45598293 1e-36
CaES1605 Pepper.v.1.5.chr10 226682702 1e-101
CaES1609 Pepper.v.1.5.chr10 422624 2e-83
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390

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