Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr09

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 256


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES0002 Pepper.v.1.5.chr09 68187362 2e-61
CaES0035 Pepper.v.1.5.chr09 102815170 7e-39
CaES0044 Pepper.v.1.5.chr09 176180063 1e-104
CaES0091 Pepper.v.1.5.chr09 205820501 2e-89
CaES0100 Pepper.v.1.5.chr09 21947601 1e-105
CaES0124 Pepper.v.1.5.chr09 195656384 1e-108
CaES0130 Pepper.v.1.5.chr09 160752132 4e-28
CaES0178 Pepper.v.1.5.chr09 3484408 3e-69
CaES0194 Pepper.v.1.5.chr09 4529776 5e-72
CaES0252 Pepper.v.1.5.chr09 1641482 9e-32
CaES0260 Pepper.v.1.5.chr09 89365919 8e-27
CaES0268 Pepper.v.1.5.chr09 10208149 2e-90
CaES0272 Pepper.v.1.5.chr09 32959113 3e-84
CaES0278 Pepper.v.1.5.chr09 54513849 1e-144
CaES0283 Pepper.v.1.5.chr09 127331335 1e-98
CaES0289 Pepper.v.1.5.chr09 1389217 1e-104
CaES0315 Pepper.v.1.5.chr09 175604714 1e-41
CaES0336 Pepper.v.1.5.chr09 118978587 1e-110
CaES0338 Pepper.v.1.5.chr09 153925666 1e-124
CaES0373 Pepper.v.1.5.chr09 185095062 3e-97
CaES0379 Pepper.v.1.5.chr09 99098972 1e-120
CaES0400 Pepper.v.1.5.chr09 683157 1e-124
CaES0409 Pepper.v.1.5.chr09 245967861 5e-79
CaES0432 Pepper.v.1.5.chr09 247700078 4e-59
CaES0450 Pepper.v.1.5.chr09 3787782 3e-23
CaES0468 Pepper.v.1.5.chr09 32182933 5e-88
CaES0481 Pepper.v.1.5.chr09 224441701 1e-79
CaES0485 Pepper.v.1.5.chr09 4409156 1e-106
CaES0504 Pepper.v.1.5.chr09 9948902 4e-91
CaES0510 Pepper.v.1.5.chr09 1639347 4e-60
CaES0511 Pepper.v.1.5.chr09 33793905 3e-27
CaES0580 Pepper.v.1.5.chr09 28239751 1e-128
CaES0585 Pepper.v.1.5.chr09 63820716 2e-87
CaES0610 Pepper.v.1.5.chr09 520139 5e-89
CaES0618 Pepper.v.1.5.chr09 208585239 1e-126
CaES0623 Pepper.v.1.5.chr09 10532583 2e-65
CaES0639 Pepper.v.1.5.chr09 3840132 2e-42
CaES0703 Pepper.v.1.5.chr09 10050213 3e-83
CaES0708 Pepper.v.1.5.chr09 6038674 7e-87
CaES0714 Pepper.v.1.5.chr09 89978994 5e-88
CaES0723 Pepper.v.1.5.chr09 3276596 1e-143
CaES0778 Pepper.v.1.5.chr09 147331930 1e-105
CaES0780 Pepper.v.1.5.chr09 4426263 1e-118
CaES0783 Pepper.v.1.5.chr09 56660267 1e-68
CaES0788 Pepper.v.1.5.chr09 24736881 1e-118
CaES0794 Pepper.v.1.5.chr09 47726196 1e-121
CaES0843 Pepper.v.1.5.chr09 4176994 3e-31
CaES0854 Pepper.v.1.5.chr09 81262496 1e-109
CaES0862 Pepper.v.1.5.chr09 188969156 3e-72
CaES0863 0.0 190 Pepper.v.1.5.chr09 195645385 1e-137
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 256

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