Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr09

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 256


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3097 Pepper.v.1.5.chr09 199435227 1e-124
CaES5076 Pepper.v.1.5.chr09 199875137 1e-22
CaES2964 Pepper.v.1.5.chr09 199876278 2e-31
CaES4153 Pepper.v.1.5.chr09 205145068 1e-142
CaES0091 Pepper.v.1.5.chr09 205820501 2e-89
CaES3358 Pepper.v.1.5.chr09 205881798 1e-121
CaES4831 Pepper.v.1.5.chr09 206950395 1e-119
CaES0618 Pepper.v.1.5.chr09 208585239 1e-126
CaES4290 Pepper.v.1.5.chr09 208628048 1e-91
CaES5666 Pepper.v.1.5.chr09 211920951 8e-29
CaES3810 Pepper.v.1.5.chr09 212239219 3e-58
CaES2182 Pepper.v.1.5.chr09 213920971 1e-135
CaES3054 Pepper.v.1.5.chr09 213946551 6e-67
CaES4100 Pepper.v.1.5.chr09 215130890 3e-22
CaES2026 Pepper.v.1.5.chr09 216237460 1e-123
CaES1187 Pepper.v.1.5.chr09 216915715 1e-122
CaES5612 Pepper.v.1.5.chr09 217112285 3e-23
CaES5044 Pepper.v.1.5.chr09 217698166 1e-115
CaES1544 Pepper.v.1.5.chr09 219347074 3e-95
CaES5717 Pepper.v.1.5.chr09 222606455 1e-123
CaES1086 Pepper.v.1.5.chr09 222859686 2e-96
CaES5712 Pepper.v.1.5.chr09 223086466 3e-82
CaES4319 Pepper.v.1.5.chr09 223180704 1e-138
CaES2841 Pepper.v.1.5.chr09 223485253 9e-62
CaES0481 Pepper.v.1.5.chr09 224441701 1e-79
CaES3139 Pepper.v.1.5.chr09 225994540 1e-135
CaES5744 Pepper.v.1.5.chr09 232030708 5e-77
CaES3888 Pepper.v.1.5.chr09 233263593 1e-151
CaES2434 Pepper.v.1.5.chr09 235362293 2e-63
CaES3353 Pepper.v.1.5.chr09 237372981 1e-69
CaES2817 Pepper.v.1.5.chr09 238018717 9e-89
CaES2276 Pepper.v.1.5.chr09 238657325 9e-29
CaES2547 Pepper.v.1.5.chr09 238840885 2e-92
CaES1894 Pepper.v.1.5.chr09 238857179 4e-59
CaES1441 Pepper.v.1.5.chr09 239082549 1e-125
CaES3763 Pepper.v.1.5.chr09 240132152 1e-102
CaES4428 Pepper.v.1.5.chr09 240638173 1e-116
CaES4841 Pepper.v.1.5.chr09 240643510 1e-43
CaES5013 Pepper.v.1.5.chr09 243226154 1e-130
CaES2039 Pepper.v.1.5.chr09 243934114 1e-105
CaES3073 Pepper.v.1.5.chr09 243975600 5e-96
CaES2215 Pepper.v.1.5.chr09 244496733 1e-78
CaES1127 Pepper.v.1.5.chr09 244496775 1e-84
CaES4680 Pepper.v.1.5.chr09 244531708 2e-65
CaES1425 Pepper.v.1.5.chr09 244821419 2e-67
CaES4003 Pepper.v.1.5.chr09 245252313 4e-90
CaES4292 Pepper.v.1.5.chr09 245252454 1e-103
CaES4143 Pepper.v.1.5.chr09 245256932 2e-87
CaES2700 Pepper.v.1.5.chr09 245540171 5e-78
CaES1199 Pepper.v.1.5.chr09 245716111 3e-76
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 256


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