Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr09

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 256


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3309 Pepper.v.1.5.chr09 88848993 1e-110
CaES3326 Pepper.v.1.5.chr09 71868241 6e-76
CaES3340 Pepper.v.1.5.chr09 32183606 2e-64
CaES3352 Pepper.v.1.5.chr09 3455030 1e-130
CaES3353 Pepper.v.1.5.chr09 237372981 1e-69
CaES3358 Pepper.v.1.5.chr09 205881798 1e-121
CaES3384 Pepper.v.1.5.chr09 63784319 1e-120
CaES3387 Pepper.v.1.5.chr09 47957251 7e-97
CaES3450 Pepper.v.1.5.chr09 177766407 1e-140
CaES3464 Pepper.v.1.5.chr09 38785474 1e-119
CaES3469 Pepper.v.1.5.chr09 3654465 1e-149
CaES3514 Pepper.v.1.5.chr09 8172447 7e-94
CaES3581 Pepper.v.1.5.chr09 154872399 1e-103
CaES3583 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr09 180480382 1e-115
CaES3591 Pepper.v.1.5.chr09 133516827 1e-101
CaES3623 Pepper.v.1.5.chr09 66768925 6e-93
CaES3625 Pepper.v.1.5.chr09 7268517 6e-94
CaES3637 Pepper.v.1.5.chr09 74947483 1e-87
CaES3647 Pepper.v.1.5.chr09 70427929 1e-131
CaES3656 Pepper.v.1.5.chr09 154448264 1e-139
CaES3665 Pepper.v.1.5.chr09 49495637 1e-103
CaES3673 Pepper.v.1.5.chr09 187741093 4e-99
CaES3710 Pepper.v.1.5.chr09 246276860 1e-142
CaES3720 Pepper.v.1.5.chr09 199434883 2e-53
CaES3728 Pepper.v.1.5.chr09 22241290 1e-102
CaES3734 Pepper.v.1.5.chr09 40746517 1e-112
CaES3748 Pepper.v.1.5.chr09 192403868 1e-120
CaES3763 Pepper.v.1.5.chr09 240132152 1e-102
CaES3790 Pepper.v.1.5.chr09 64725414 2e-78
CaES3798 Pepper.v.1.5.chr09 103241992 1e-154
CaES3800 Pepper.v.1.5.chr09 99537137 1e-121
CaES3810 Pepper.v.1.5.chr09 212239219 3e-58
CaES3814 Pepper.v.1.5.chr09 9977937 1e-119
CaES3823 Pepper.v.1.5.chr09 683979 1e-107
CaES3835 Pepper.v.1.5.chr09 699906 1e-113
CaES3853 Pepper.v.1.5.chr09 2120134 1e-143
CaES3888 Pepper.v.1.5.chr09 233263593 1e-151
CaES3913 Pepper.v.1.5.chr09 1381369 1e-127
CaES3949 Pepper.v.1.5.chr09 185561190 1e-110
CaES4003 Pepper.v.1.5.chr09 245252313 4e-90
CaES4064 Pepper.v.1.5.chr09 46504340 1e-28
CaES4100 Pepper.v.1.5.chr09 215130890 3e-22
CaES4143 Pepper.v.1.5.chr09 245256932 2e-87
CaES4153 Pepper.v.1.5.chr09 205145068 1e-142
CaES4182 Pepper.v.1.5.chr09 133516827 8e-92
CaES4192 0.271 192 Pepper.v.1.5.chr09 21458850 1e-122
CaES4219 Pepper.v.1.5.chr09 190702316 1e-60
CaES4272 Pepper.v.1.5.chr09 3974506 3e-73
CaES4290 Pepper.v.1.5.chr09 208628048 1e-91
CaES4292 Pepper.v.1.5.chr09 245252454 1e-103
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 256


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