Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr09

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 256


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1660 Pepper.v.1.5.chr09 41576779 1e-113
CaES1678 Pepper.v.1.5.chr09 44279446 4e-87
CaES2013 Pepper.v.1.5.chr09 45633715 1e-115
CaES4064 Pepper.v.1.5.chr09 46504340 1e-28
CaES2534 Pepper.v.1.5.chr09 46505016 5e-96
CaES0794 Pepper.v.1.5.chr09 47726196 1e-121
CaES3387 Pepper.v.1.5.chr09 47957251 7e-97
CaES3665 Pepper.v.1.5.chr09 49495637 1e-103
CaES5396 Pepper.v.1.5.chr09 50367275 8e-37
CaES4986 Pepper.v.1.5.chr09 51066374 2e-24
CaES1217 Pepper.v.1.5.chr09 51105005 1e-113
CaES3300 Pepper.v.1.5.chr09 52111971 1e-131
CaES1034 Pepper.v.1.5.chr09 52120025 1e-104
CaES2270 Pepper.v.1.5.chr09 52201482 2e-71
CaES0278 Pepper.v.1.5.chr09 54513849 1e-144
CaES5064 Pepper.v.1.5.chr09 56428102 1e-99
CaES2048 Pepper.v.1.5.chr09 56626984 1e-65
CaES0783 Pepper.v.1.5.chr09 56660267 1e-68
CaES1916 Pepper.v.1.5.chr09 60465945 1e-137
CaES4851 Pepper.v.1.5.chr09 61748809 1e-100
CaES1640 Pepper.v.1.5.chr09 63000159 1e-131
CaES3384 Pepper.v.1.5.chr09 63784319 1e-120
CaES0585 Pepper.v.1.5.chr09 63820716 2e-87
CaES3790 Pepper.v.1.5.chr09 64725414 2e-78
CaES5436 Pepper.v.1.5.chr09 65064339 5e-46
CaES2011 Pepper.v.1.5.chr09 65908159 3e-55
CaES1657 Pepper.v.1.5.chr09 65955006 5e-55
CaES3623 Pepper.v.1.5.chr09 66768925 6e-93
CaES0002 Pepper.v.1.5.chr09 68187362 2e-61
CaES3647 Pepper.v.1.5.chr09 70427929 1e-131
CaES2449 Pepper.v.1.5.chr09 71466360 5e-92
CaES1085 Pepper.v.1.5.chr09 71857978 1e-106
CaES3326 Pepper.v.1.5.chr09 71868241 6e-76
CaES5083 Pepper.v.1.5.chr09 74947462 1e-92
CaES3637 Pepper.v.1.5.chr09 74947483 1e-87
CaES2369 Pepper.v.1.5.chr09 75496791 2e-94
CaES5242 Pepper.v.1.5.chr09 75497753 8e-79
CaES5134 Pepper.v.1.5.chr09 77113019 1e-110
CaES4687 Pepper.v.1.5.chr09 79642835 1e-29
CaES0854 Pepper.v.1.5.chr09 81262496 1e-109
CaES3240 Pepper.v.1.5.chr09 81716203 9e-35
CaES5363 Pepper.v.1.5.chr09 82126319 1e-124
CaES1023 Pepper.v.1.5.chr09 87694882 1e-146
CaES3309 Pepper.v.1.5.chr09 88848993 1e-110
CaES0260 Pepper.v.1.5.chr09 89365919 8e-27
CaES0714 Pepper.v.1.5.chr09 89978994 5e-88
CaES1730 Pepper.v.1.5.chr09 91214746 1e-150
CaES5142 Pepper.v.1.5.chr09 91215017 1e-34
CaES2273 Pepper.v.1.5.chr09 92238371 1e-132
CaES1054 Pepper.v.1.5.chr09 99082136 1e-124
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 256


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