Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr09

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 256


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2090 Pepper.v.1.5.chr09 165829142 2e-47
CaES2158 Pepper.v.1.5.chr09 10483896 1e-126
CaES2182 Pepper.v.1.5.chr09 213920971 1e-135
CaES2213 Pepper.v.1.5.chr09 3801487 2e-27
CaES2215 Pepper.v.1.5.chr09 244496733 1e-78
CaES2270 Pepper.v.1.5.chr09 52201482 2e-71
CaES2273 Pepper.v.1.5.chr09 92238371 1e-132
CaES2276 Pepper.v.1.5.chr09 238657325 9e-29
CaES2328 Pepper.v.1.5.chr09 118442308 1e-147
CaES2369 Pepper.v.1.5.chr09 75496791 2e-94
CaES2381 Pepper.v.1.5.chr09 9885335 1e-111
CaES2395 Pepper.v.1.5.chr09 2119708 8e-85
CaES2405 Pepper.v.1.5.chr09 4529795 3e-35
CaES2434 Pepper.v.1.5.chr09 235362293 2e-63
CaES2449 Pepper.v.1.5.chr09 71466360 5e-92
CaES2463 Pepper.v.1.5.chr09 133516013 1e-33
CaES2478 Pepper.v.1.5.chr09 2480917 5e-26
CaES2490 Pepper.v.1.5.chr09 2878436 9e-55
CaES2494 Pepper.v.1.5.chr09 103942364 2e-23
CaES2534 Pepper.v.1.5.chr09 46505016 5e-96
CaES2547 Pepper.v.1.5.chr09 238840885 2e-92
CaES2569 Pepper.v.1.5.chr09 9973058 7e-97
CaES2581 Pepper.v.1.5.chr09 173619496 1e-138
CaES2589 Pepper.v.1.5.chr09 121797984 3e-88
CaES2611 Pepper.v.1.5.chr09 38146684 1e-147
CaES2638 Pepper.v.1.5.chr09 6038062 3e-69
CaES2646 Pepper.v.1.5.chr09 24977239 1e-100
CaES2673 Pepper.v.1.5.chr09 246323902 1e-125
CaES2700 Pepper.v.1.5.chr09 245540171 5e-78
CaES2776 Pepper.v.1.5.chr09 8496985 1e-129
CaES2817 Pepper.v.1.5.chr09 238018717 9e-89
CaES2841 Pepper.v.1.5.chr09 223485253 9e-62
CaES2844 Pepper.v.1.5.chr09 3654712 1e-132
CaES2852 Pepper.v.1.5.chr09 22179715 1e-104
CaES2867 Pepper.v.1.5.chr09 100985704 4e-83
CaES2917 Pepper.v.1.5.chr09 172232171 1e-145
CaES2930 0.234 192 Pepper.v.1.5.chr09 136148088 1e-143
CaES2964 Pepper.v.1.5.chr09 199876278 2e-31
CaES2975 Pepper.v.1.5.chr09 34534633 1e-155
CaES2978 Pepper.v.1.5.chr09 4129853 2e-98
CaES2983 Pepper.v.1.5.chr09 30741695 1e-139
CaES3054 Pepper.v.1.5.chr09 213946551 6e-67
CaES3073 Pepper.v.1.5.chr09 243975600 5e-96
CaES3097 Pepper.v.1.5.chr09 199435227 1e-124
CaES3139 Pepper.v.1.5.chr09 225994540 1e-135
CaES3140 Pepper.v.1.5.chr09 39200762 1e-108
CaES3240 Pepper.v.1.5.chr09 81716203 9e-35
CaES3252 Pepper.v.1.5.chr09 192428052 1e-96
CaES3295 Pepper.v.1.5.chr09 21554696 6e-96
CaES3300 Pepper.v.1.5.chr09 52111971 1e-131
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 256


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