Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr09

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 256


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES5021 Pepper.v.1.5.chr09 5860219 1e-116
CaES2638 Pepper.v.1.5.chr09 6038062 3e-69
CaES0708 Pepper.v.1.5.chr09 6038674 7e-87
CaES3625 Pepper.v.1.5.chr09 7268517 6e-94
CaES1372 Pepper.v.1.5.chr09 7405740 1e-109
CaES3514 Pepper.v.1.5.chr09 8172447 7e-94
CaES2776 Pepper.v.1.5.chr09 8496985 1e-129
CaES5749 Pepper.v.1.5.chr09 9679894 8e-72
CaES2381 Pepper.v.1.5.chr09 9885335 1e-111
CaES0504 Pepper.v.1.5.chr09 9948902 4e-91
CaES2569 Pepper.v.1.5.chr09 9973058 7e-97
CaES3814 Pepper.v.1.5.chr09 9977937 1e-119
CaES4452 Pepper.v.1.5.chr09 10042076 2e-79
CaES0703 Pepper.v.1.5.chr09 10050213 3e-83
CaES0268 Pepper.v.1.5.chr09 10208149 2e-90
CaES2158 Pepper.v.1.5.chr09 10483896 1e-126
CaES0623 Pepper.v.1.5.chr09 10532583 2e-65
CaES1836 Pepper.v.1.5.chr09 11070278 1e-135
CaES1318 Pepper.v.1.5.chr09 19504989 1e-110
CaES3295 Pepper.v.1.5.chr09 21554696 6e-96
CaES1993 Pepper.v.1.5.chr09 21801961 1e-110
CaES5345 Pepper.v.1.5.chr09 21802130 2e-73
CaES0100 Pepper.v.1.5.chr09 21947601 1e-105
CaES5535 Pepper.v.1.5.chr09 22122813 7e-81
CaES1401 Pepper.v.1.5.chr09 22179709 5e-73
CaES2852 Pepper.v.1.5.chr09 22179715 1e-104
CaES3728 Pepper.v.1.5.chr09 22241290 1e-102
CaES1170 Pepper.v.1.5.chr09 22804774 3e-29
CaES2080 Pepper.v.1.5.chr09 23015575 5e-98
CaES1017 Pepper.v.1.5.chr09 23057667 4e-41
CaES0788 Pepper.v.1.5.chr09 24736881 1e-118
CaES2646 Pepper.v.1.5.chr09 24977239 1e-100
CaES1151 Pepper.v.1.5.chr09 27474260 1e-100
CaES5373 Pepper.v.1.5.chr09 28204683 9e-71
CaES0580 Pepper.v.1.5.chr09 28239751 1e-128
CaES2983 Pepper.v.1.5.chr09 30741695 1e-139
CaES0468 Pepper.v.1.5.chr09 32182933 5e-88
CaES1040 Pepper.v.1.5.chr09 32183115 2e-50
CaES3340 Pepper.v.1.5.chr09 32183606 2e-64
CaES1800 Pepper.v.1.5.chr09 32265886 8e-38
CaES2005 Pepper.v.1.5.chr09 32735841 1e-71
CaES0272 Pepper.v.1.5.chr09 32959113 3e-84
CaES0511 Pepper.v.1.5.chr09 33793905 3e-27
CaES2975 Pepper.v.1.5.chr09 34534633 1e-155
CaES5159 Pepper.v.1.5.chr09 36591093 7e-21
CaES2611 Pepper.v.1.5.chr09 38146684 1e-147
CaES5147 Pepper.v.1.5.chr09 38411816 8e-40
CaES3464 Pepper.v.1.5.chr09 38785474 1e-119
CaES3140 Pepper.v.1.5.chr09 39200762 1e-108
CaES3734 Pepper.v.1.5.chr09 40746517 1e-112
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 256


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