Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr09

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 256


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0962 Pepper.v.1.5.chr09 121646985 1e-115
CaES0989 Pepper.v.1.5.chr09 195656601 1e-99
CaES1017 Pepper.v.1.5.chr09 23057667 4e-41
CaES1023 Pepper.v.1.5.chr09 87694882 1e-146
CaES1034 Pepper.v.1.5.chr09 52120025 1e-104
CaES1040 Pepper.v.1.5.chr09 32183115 2e-50
CaES1043 Pepper.v.1.5.chr09 154874040 1e-164
CaES1054 Pepper.v.1.5.chr09 99082136 1e-124
CaES1066 Pepper.v.1.5.chr09 173381799 1e-72
CaES1085 Pepper.v.1.5.chr09 71857978 1e-106
CaES1086 Pepper.v.1.5.chr09 222859686 2e-96
CaES1092 Pepper.v.1.5.chr09 704425 2e-62
CaES1127 Pepper.v.1.5.chr09 244496775 1e-84
CaES1151 Pepper.v.1.5.chr09 27474260 1e-100
CaES1170 Pepper.v.1.5.chr09 22804774 3e-29
CaES1187 Pepper.v.1.5.chr09 216915715 1e-122
CaES1192 Pepper.v.1.5.chr09 3801355 1e-111
CaES1199 Pepper.v.1.5.chr09 245716111 3e-76
CaES1217 Pepper.v.1.5.chr09 51105005 1e-113
CaES1317 Pepper.v.1.5.chr09 134488644 3e-37
CaES1318 Pepper.v.1.5.chr09 19504989 1e-110
CaES1372 Pepper.v.1.5.chr09 7405740 1e-109
CaES1401 Pepper.v.1.5.chr09 22179709 5e-73
CaES1425 Pepper.v.1.5.chr09 244821419 2e-67
CaES1441 Pepper.v.1.5.chr09 239082549 1e-125
CaES1474 Pepper.v.1.5.chr09 191484689 1e-79
CaES1529 Pepper.v.1.5.chr09 704345 2e-57
CaES1544 Pepper.v.1.5.chr09 219347074 3e-95
CaES1567 Pepper.v.1.5.chr09 3729537 2e-72
CaES1640 Pepper.v.1.5.chr09 63000159 1e-131
CaES1657 Pepper.v.1.5.chr09 65955006 5e-55
CaES1660 Pepper.v.1.5.chr09 41576779 1e-113
CaES1678 Pepper.v.1.5.chr09 44279446 4e-87
CaES1730 Pepper.v.1.5.chr09 91214746 1e-150
CaES1760 Pepper.v.1.5.chr09 2677851 6e-82
CaES1788 Pepper.v.1.5.chr09 4177207 2e-53
CaES1800 Pepper.v.1.5.chr09 32265886 8e-38
CaES1836 Pepper.v.1.5.chr09 11070278 1e-135
CaES1851 Pepper.v.1.5.chr09 123317355 1e-115
CaES1894 Pepper.v.1.5.chr09 238857179 4e-59
CaES1916 Pepper.v.1.5.chr09 60465945 1e-137
CaES1993 Pepper.v.1.5.chr09 21801961 1e-110
CaES2005 Pepper.v.1.5.chr09 32735841 1e-71
CaES2011 Pepper.v.1.5.chr09 65908159 3e-55
CaES2013 Pepper.v.1.5.chr09 45633715 1e-115
CaES2026 Pepper.v.1.5.chr09 216237460 1e-123
CaES2039 Pepper.v.1.5.chr09 243934114 1e-105
CaES2048 Pepper.v.1.5.chr09 56626984 1e-65
CaES2080 Pepper.v.1.5.chr09 23015575 5e-98
CaES2081 Pepper.v.1.5.chr09 99297824 1e-89
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 256


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