Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr09

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 256


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES5543 Pepper.v.1.5.chr09 492407 1e-94
CaES0610 Pepper.v.1.5.chr09 520139 5e-89
CaES0400 Pepper.v.1.5.chr09 683157 1e-124
CaES3823 Pepper.v.1.5.chr09 683979 1e-107
CaES3835 Pepper.v.1.5.chr09 699906 1e-113
CaES1529 Pepper.v.1.5.chr09 704345 2e-57
CaES1092 Pepper.v.1.5.chr09 704425 2e-62
CaES3913 Pepper.v.1.5.chr09 1381369 1e-127
CaES0289 Pepper.v.1.5.chr09 1389217 1e-104
CaES4506 Pepper.v.1.5.chr09 1391890 1e-102
CaES4637 Pepper.v.1.5.chr09 1589121 2e-98
CaES4882 Pepper.v.1.5.chr09 1618435 2e-98
CaES0510 Pepper.v.1.5.chr09 1639347 4e-60
CaES0252 Pepper.v.1.5.chr09 1641482 9e-32
CaES4905 Pepper.v.1.5.chr09 1651739 1e-145
CaES5012 Pepper.v.1.5.chr09 1841752 1e-141
CaES4438 Pepper.v.1.5.chr09 1993259 5e-72
CaES4811 Pepper.v.1.5.chr09 2097298 4e-98
CaES2395 Pepper.v.1.5.chr09 2119708 8e-85
CaES3853 Pepper.v.1.5.chr09 2120134 1e-143
CaES2478 Pepper.v.1.5.chr09 2480917 5e-26
CaES4985 Pepper.v.1.5.chr09 2503841 1e-116
CaES1760 Pepper.v.1.5.chr09 2677851 6e-82
CaES2490 Pepper.v.1.5.chr09 2878436 9e-55
CaES0723 Pepper.v.1.5.chr09 3276596 1e-143
CaES3352 Pepper.v.1.5.chr09 3455030 1e-130
CaES0178 Pepper.v.1.5.chr09 3484408 3e-69
CaES5341 Pepper.v.1.5.chr09 3555820 6e-80
CaES3469 Pepper.v.1.5.chr09 3654465 1e-149
CaES2844 Pepper.v.1.5.chr09 3654712 1e-132
CaES1567 Pepper.v.1.5.chr09 3729537 2e-72
CaES0450 Pepper.v.1.5.chr09 3787782 3e-23
CaES1192 Pepper.v.1.5.chr09 3801355 1e-111
CaES2213 Pepper.v.1.5.chr09 3801487 2e-27
CaES0639 Pepper.v.1.5.chr09 3840132 2e-42
CaES4272 Pepper.v.1.5.chr09 3974506 3e-73
CaES2978 Pepper.v.1.5.chr09 4129853 2e-98
CaES5249 Pepper.v.1.5.chr09 4176992 6e-33
CaES0843 Pepper.v.1.5.chr09 4176994 3e-31
CaES1788 Pepper.v.1.5.chr09 4177207 2e-53
CaES5240 Pepper.v.1.5.chr09 4408783 1e-85
CaES0485 Pepper.v.1.5.chr09 4409156 1e-106
CaES0780 Pepper.v.1.5.chr09 4426263 1e-118
CaES0194 Pepper.v.1.5.chr09 4529776 5e-72
CaES2405 Pepper.v.1.5.chr09 4529795 3e-35
CaES5021 Pepper.v.1.5.chr09 5860219 1e-116
CaES2638 Pepper.v.1.5.chr09 6038062 3e-69
CaES0708 Pepper.v.1.5.chr09 6038674 7e-87
CaES3625 Pepper.v.1.5.chr09 7268517 6e-94
CaES1372 Pepper.v.1.5.chr09 7405740 1e-109
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 256


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