Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr08

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 273


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0054 Pepper.v.1.5.chr08 1727535 1e-117
CaES0077 Pepper.v.1.5.chr08 127635818 1e-57
CaES0086 Pepper.v.1.5.chr08 127156962 2e-63
CaES0093 Pepper.v.1.5.chr08 123976528 7e-64
CaES0128 Pepper.v.1.5.chr08 29850862 1e-105
CaES0160 Pepper.v.1.5.chr08 123518013 1e-122
CaES0162 Pepper.v.1.5.chr08 86228946 1e-140
CaES0167 Pepper.v.1.5.chr08 85089136 4e-43
CaES0168 Pepper.v.1.5.chr08 133324307 7e-50
CaES0175 Pepper.v.1.5.chr08 88391335 2e-38
CaES0209 Pepper.v.1.5.chr08 126444388 1e-137
CaES0219 Pepper.v.1.5.chr08 62571176 1e-85
CaES0239 Pepper.v.1.5.chr08 2939183 2e-25
CaES0299 Pepper.v.1.5.chr08 124350745 1e-25
CaES0345 Pepper.v.1.5.chr08 29899511 7e-68
CaES0347 Pepper.v.1.5.chr08 124578567 1e-110
CaES0360 Pepper.v.1.5.chr08 131961925 1e-129
CaES0398 Pepper.v.1.5.chr08 1960118 1e-89
CaES0403 Pepper.v.1.5.chr08 131023876 1e-68
CaES0406 Pepper.v.1.5.chr08 126542273 2e-55
CaES0416 Pepper.v.1.5.chr08 129965594 1e-144
CaES0440 Pepper.v.1.5.chr08 124010156 3e-78
CaES0459 Pepper.v.1.5.chr08 132715347 3e-97
CaES0476 Pepper.v.1.5.chr08 130892873 5e-95
CaES0490 Pepper.v.1.5.chr08 126344207 6e-73
CaES0500 Pepper.v.1.5.chr08 133978103 2e-25
CaES0521 Pepper.v.1.5.chr08 130940908 1e-132
CaES0555 Pepper.v.1.5.chr08 128049423 3e-97
CaES0564 Pepper.v.1.5.chr08 129782940 2e-94
CaES0598 Pepper.v.1.5.chr08 116665387 1e-116
CaES0619 Pepper.v.1.5.chr08 124833854 1e-117
CaES0662 Pepper.v.1.5.chr08 123908324 5e-45
CaES0687 Pepper.v.1.5.chr08 24843438 2e-95
CaES0701 Pepper.v.1.5.chr08 128035011 1e-109
CaES0720 Pepper.v.1.5.chr08 125232145 1e-140
CaES0736 Pepper.v.1.5.chr08 113420937 1e-104
CaES0758 Pepper.v.1.5.chr08 129405677 1e-151
CaES0796 Pepper.v.1.5.chr08 127272438 7e-62
CaES0813 Pepper.v.1.5.chr08 81165030 1e-110
CaES0815 Pepper.v.1.5.chr08 129795852 1e-92
CaES0846 Pepper.v.1.5.chr08 116891307 1e-109
CaES0858 Pepper.v.1.5.chr08 129158814 1e-109
CaES0860 Pepper.v.1.5.chr08 51677998 1e-76
CaES0904 Pepper.v.1.5.chr08 129327491 2e-86
CaES0910 Pepper.v.1.5.chr08 123308225 3e-94
CaES0950 Pepper.v.1.5.chr08 2932168 2e-85
CaES0961 Pepper.v.1.5.chr08 129330999 1e-133
CaES0993 Pepper.v.1.5.chr08 131823465 1e-90
CaES1000 Pepper.v.1.5.chr08 133323543 3e-99
CaES1019 Pepper.v.1.5.chr08 51154777 3e-44
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 273


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