Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr08

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 273


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4113 Pepper.v.1.5.chr08 129404824 1e-129
CaES4117 Pepper.v.1.5.chr08 1126585 5e-63
CaES4169 Pepper.v.1.5.chr08 9863138 1e-107
CaES4174 Pepper.v.1.5.chr08 71857225 1e-112
CaES4185 Pepper.v.1.5.chr08 133894218 1e-97
CaES4194 Pepper.v.1.5.chr08 112052700 1e-64
CaES4237 Pepper.v.1.5.chr08 133999309 1e-148
CaES4246 Pepper.v.1.5.chr08 127958896 1e-76
CaES4260 Pepper.v.1.5.chr08 85802258 1e-109
CaES4269 Pepper.v.1.5.chr08 131151801 3e-71
CaES4284 Pepper.v.1.5.chr08 130192649 1e-153
CaES4313 Pepper.v.1.5.chr08 123989450 6e-81
CaES4318 Pepper.v.1.5.chr08 129224446 3e-79
CaES4334 Pepper.v.1.5.chr08 134232573 1e-124
CaES4338 Pepper.v.1.5.chr08 122059056 6e-86
CaES4351 Pepper.v.1.5.chr08 124020349 1e-128
CaES4358 Pepper.v.1.5.chr08 132896308 1e-127
CaES4390 Pepper.v.1.5.chr08 55075717 4e-83
CaES4393 Pepper.v.1.5.chr08 131879195 1e-111
CaES4397 Pepper.v.1.5.chr08 765791 9e-89
CaES4410 0.498 191 Pepper.v.1.5.chr08 78590091 1e-111
CaES4432 Pepper.v.1.5.chr08 15541150 1e-146
CaES4468 Pepper.v.1.5.chr08 127272438 9e-99
CaES4505 Pepper.v.1.5.chr08 85283620 1e-105
CaES4509 Pepper.v.1.5.chr08 130766592 1e-116
CaES4517 Pepper.v.1.5.chr08 130106192 1e-144
CaES4542 Pepper.v.1.5.chr08 127965375 1e-107
CaES4564 Pepper.v.1.5.chr08 1177764 1e-118
CaES4565 Pepper.v.1.5.chr08 129361947 1e-118
CaES4571 Pepper.v.1.5.chr08 121929170 2e-95
CaES4578 Pepper.v.1.5.chr08 89150053 1e-142
CaES4579 Pepper.v.1.5.chr08 131315466 1e-126
CaES4585 Pepper.v.1.5.chr08 128010145 1e-103
CaES4589 Pepper.v.1.5.chr08 122294980 1e-114
CaES4596 Pepper.v.1.5.chr08 87708924 2e-81
CaES4609 Pepper.v.1.5.chr08 125339905 4e-71
CaES4615 Pepper.v.1.5.chr08 129121462 1e-139
CaES4625 Pepper.v.1.5.chr08 45335015 1e-107
CaES4629 Pepper.v.1.5.chr08 2931788 3e-74
CaES4641 Pepper.v.1.5.chr08 132518941 3e-46
CaES4677 Pepper.v.1.5.chr08 41988515 1e-134
CaES4693 Pepper.v.1.5.chr08 997253 1e-50
CaES4696 Pepper.v.1.5.chr08 129177555 3e-94
CaES4700 Pepper.v.1.5.chr08 72221734 2e-56
CaES4719 Pepper.v.1.5.chr08 2206497 8e-82
CaES4816 Pepper.v.1.5.chr08 3606073 3e-63
CaES4865 Pepper.v.1.5.chr08 125090391 1e-105
CaES4928 Pepper.v.1.5.chr08 104756960 1e-64
CaES4937 Pepper.v.1.5.chr08 1211727 1e-127
CaES4953 Pepper.v.1.5.chr08 29851141 1e-131
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 273


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