Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr08

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 273


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4615 Pepper.v.1.5.chr08 129121462 1e-139
CaES0858 Pepper.v.1.5.chr08 129158814 1e-109
CaES4696 Pepper.v.1.5.chr08 129177555 3e-94
CaES1184 Pepper.v.1.5.chr08 129222980 7e-64
CaES4318 Pepper.v.1.5.chr08 129224446 3e-79
CaES3480 Pepper.v.1.5.chr08 129241833 2e-77
CaES3263 Pepper.v.1.5.chr08 129303921 7e-83
CaES2951 Pepper.v.1.5.chr08 129327467 1e-121
CaES0904 Pepper.v.1.5.chr08 129327491 2e-86
CaES0961 Pepper.v.1.5.chr08 129330999 1e-133
CaES4565 Pepper.v.1.5.chr08 129361947 1e-118
CaES4113 Pepper.v.1.5.chr08 129404824 1e-129
CaES0758 Pepper.v.1.5.chr08 129405677 1e-151
CaES1880 Pepper.v.1.5.chr08 129422488 7e-57
CaES1785 Pepper.v.1.5.chr08 129501130 1e-23
CaES2178 Pepper.v.1.5.chr08 129768029 5e-90
CaES2945 Pepper.v.1.5.chr08 129774717 6e-76
CaES0564 Pepper.v.1.5.chr08 129782940 2e-94
CaES0815 Pepper.v.1.5.chr08 129795852 1e-92
CaES2766 Pepper.v.1.5.chr08 129952503 3e-74
CaES0416 Pepper.v.1.5.chr08 129965594 1e-144
CaES4517 Pepper.v.1.5.chr08 130106192 1e-144
CaES4284 Pepper.v.1.5.chr08 130192649 1e-153
CaES3116 Pepper.v.1.5.chr08 130581585 1e-122
CaES4509 Pepper.v.1.5.chr08 130766592 1e-116
CaES2707 Pepper.v.1.5.chr08 130798544 1e-118
CaES3882 Pepper.v.1.5.chr08 130800445 1e-81
CaES0476 Pepper.v.1.5.chr08 130892873 5e-95
CaES1909 Pepper.v.1.5.chr08 130928971 1e-148
CaES1459 Pepper.v.1.5.chr08 130940843 1e-123
CaES0521 Pepper.v.1.5.chr08 130940908 1e-132
CaES3435 Pepper.v.1.5.chr08 130993362 1e-159
CaES0403 Pepper.v.1.5.chr08 131023876 1e-68
CaES4023 Pepper.v.1.5.chr08 131109775 2e-94
CaES1964 Pepper.v.1.5.chr08 131145655 1e-111
CaES4269 Pepper.v.1.5.chr08 131151801 3e-71
CaES1220 Pepper.v.1.5.chr08 131232863 1e-112
CaES4579 Pepper.v.1.5.chr08 131315466 1e-126
CaES1711 0.474 140 Pepper.v.1.5.chr08 131373766 2e-77
CaES2500 Pepper.v.1.5.chr08 131402462 1e-21
CaES4059 Pepper.v.1.5.chr08 131466840 1e-64
CaES2017 Pepper.v.1.5.chr08 131476105 3e-85
CaES3774 Pepper.v.1.5.chr08 131494043 1e-117
CaES2715 Pepper.v.1.5.chr08 131508017 6e-79
CaES1623 Pepper.v.1.5.chr08 131788083 2e-28
CaES2169 Pepper.v.1.5.chr08 131788290 4e-79
CaES3332 Pepper.v.1.5.chr08 131789460 1e-34
CaES0993 Pepper.v.1.5.chr08 131823465 1e-90
CaES5108 Pepper.v.1.5.chr08 131825752 1e-66
CaES4393 Pepper.v.1.5.chr08 131879195 1e-111
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 273


MarkerDB | Capsicum annuum