Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr08

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 273


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES5221 Pepper.v.1.5.chr08 124057870 5e-95
CaES3802 Pepper.v.1.5.chr08 124066234 1e-124
CaES1290 Pepper.v.1.5.chr08 124116785 1e-136
CaES0299 Pepper.v.1.5.chr08 124350745 1e-25
CaES4045 Pepper.v.1.5.chr08 124479007 4e-38
CaES0347 Pepper.v.1.5.chr08 124578567 1e-110
CaES3129 Pepper.v.1.5.chr08 124627618 1e-111
CaES3331 Pepper.v.1.5.chr08 124727804 4e-59
CaES0619 Pepper.v.1.5.chr08 124833854 1e-117
CaES3705 Pepper.v.1.5.chr08 124833926 7e-90
CaES1222 Pepper.v.1.5.chr08 124845702 1e-123
CaES2559 Pepper.v.1.5.chr08 124994943 1e-71
CaES4865 Pepper.v.1.5.chr08 125090391 1e-105
CaES5627 Pepper.v.1.5.chr08 125132614 1e-95
CaES0720 Pepper.v.1.5.chr08 125232145 1e-140
CaES2001 Pepper.v.1.5.chr08 125315911 8e-86
CaES4609 Pepper.v.1.5.chr08 125339905 4e-71
CaES4065 Pepper.v.1.5.chr08 125414535 1e-116
CaES3043 Pepper.v.1.5.chr08 125415156 1e-118
CaES3588 Pepper.v.1.5.chr08 125603601 1e-69
CaES3394 Pepper.v.1.5.chr08 125938852 9e-93
CaES2197 Pepper.v.1.5.chr08 125994983 1e-120
CaES2877 Pepper.v.1.5.chr08 126001279 1e-113
CaES1636 Pepper.v.1.5.chr08 126327778 1e-119
CaES0490 Pepper.v.1.5.chr08 126344207 6e-73
CaES2727 Pepper.v.1.5.chr08 126440628 1e-128
CaES0209 Pepper.v.1.5.chr08 126444388 1e-137
CaES0406 Pepper.v.1.5.chr08 126542273 2e-55
CaES1955 Pepper.v.1.5.chr08 126643470 1e-84
CaES4052 Pepper.v.1.5.chr08 126773105 1e-92
CaES2007 Pepper.v.1.5.chr08 126947610 5e-54
CaES4075 Pepper.v.1.5.chr08 126960447 1e-121
CaES2392 Pepper.v.1.5.chr08 126979413 1e-146
CaES0086 Pepper.v.1.5.chr08 127156962 2e-63
CaES5297 Pepper.v.1.5.chr08 127241511 6e-61
CaES5455 Pepper.v.1.5.chr08 127249674 7e-95
CaES3298 Pepper.v.1.5.chr08 127259079 1e-42
CaES4468 Pepper.v.1.5.chr08 127272438 9e-99
CaES0796 Pepper.v.1.5.chr08 127272438 7e-62
CaES1536 Pepper.v.1.5.chr08 127569540 4e-70
CaES2347 Pepper.v.1.5.chr08 127575392 1e-109
CaES0077 Pepper.v.1.5.chr08 127635818 1e-57
CaES4246 Pepper.v.1.5.chr08 127958896 1e-76
CaES4542 Pepper.v.1.5.chr08 127965375 1e-107
CaES4585 Pepper.v.1.5.chr08 128010145 1e-103
CaES0701 Pepper.v.1.5.chr08 128035011 1e-109
CaES3635 Pepper.v.1.5.chr08 128046045 1e-149
CaES0555 Pepper.v.1.5.chr08 128049423 3e-97
CaES3243 Pepper.v.1.5.chr08 128340705 1e-77
CaES5298 Pepper.v.1.5.chr08 128340799 3e-29
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 273


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