Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr08

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 273


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3170 Pepper.v.1.5.chr08 938058 2e-78
CaES3243 Pepper.v.1.5.chr08 128340705 1e-77
CaES3263 Pepper.v.1.5.chr08 129303921 7e-83
CaES3298 Pepper.v.1.5.chr08 127259079 1e-42
CaES3327 Pepper.v.1.5.chr08 24842937 1e-110
CaES3331 Pepper.v.1.5.chr08 124727804 4e-59
CaES3332 Pepper.v.1.5.chr08 131789460 1e-34
CaES3372 Pepper.v.1.5.chr08 2428260 1e-136
CaES3394 Pepper.v.1.5.chr08 125938852 9e-93
CaES3426 Pepper.v.1.5.chr08 119213401 3e-25
CaES3434 Pepper.v.1.5.chr08 51085583 2e-49
CaES3435 Pepper.v.1.5.chr08 130993362 1e-159
CaES3446 Pepper.v.1.5.chr08 112792951 1e-125
CaES3480 Pepper.v.1.5.chr08 129241833 2e-77
CaES3487 Pepper.v.1.5.chr08 29856191 1e-126
CaES3527 Pepper.v.1.5.chr08 65445541 1e-115
CaES3539 Pepper.v.1.5.chr08 55181782 8e-75
CaES3540 Pepper.v.1.5.chr08 38188752 1e-102
CaES3579 Pepper.v.1.5.chr08 939041 1e-140
CaES3588 Pepper.v.1.5.chr08 125603601 1e-69
CaES3602 Pepper.v.1.5.chr08 104753130 1e-139
CaES3612 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr08 46954912 1e-162
CaES3635 Pepper.v.1.5.chr08 128046045 1e-149
CaES3640 Pepper.v.1.5.chr08 52179783 5e-83
CaES3671 Pepper.v.1.5.chr08 124022189 1e-133
CaES3683 Pepper.v.1.5.chr08 116852425 2e-95
CaES3689 Pepper.v.1.5.chr08 1247988 1e-136
CaES3695 Pepper.v.1.5.chr08 134727170 1e-111
CaES3705 Pepper.v.1.5.chr08 124833926 7e-90
CaES3709 Pepper.v.1.5.chr08 122891153 1e-128
CaES3747 Pepper.v.1.5.chr08 104797811 1e-149
CaES3757 Pepper.v.1.5.chr08 980927 1e-103
CaES3761 Pepper.v.1.5.chr08 939275 8e-85
CaES3774 Pepper.v.1.5.chr08 131494043 1e-117
CaES3797 Pepper.v.1.5.chr08 79515021 1e-120
CaES3802 Pepper.v.1.5.chr08 124066234 1e-124
CaES3848 Pepper.v.1.5.chr08 71513578 1e-110
CaES3862 0.17 192 Pepper.v.1.5.chr08 1838016 1e-143
CaES3882 Pepper.v.1.5.chr08 130800445 1e-81
CaES3926 Pepper.v.1.5.chr08 66078893 1e-112
CaES3939 Pepper.v.1.5.chr08 88487740 5e-59
CaES4006 Pepper.v.1.5.chr08 96194135 1e-155
CaES4023 Pepper.v.1.5.chr08 131109775 2e-94
CaES4042 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr08 63818171 1e-126
CaES4045 Pepper.v.1.5.chr08 124479007 4e-38
CaES4052 Pepper.v.1.5.chr08 126773105 1e-92
CaES4059 Pepper.v.1.5.chr08 131466840 1e-64
CaES4065 Pepper.v.1.5.chr08 125414535 1e-116
CaES4075 Pepper.v.1.5.chr08 126960447 1e-121
CaES4106 Pepper.v.1.5.chr08 33474720 5e-92
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 273


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