Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr08

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 273


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4957 Pepper.v.1.5.chr08 86229669 1e-37
CaES4596 Pepper.v.1.5.chr08 87708924 2e-81
CaES0175 Pepper.v.1.5.chr08 88391335 2e-38
CaES3939 Pepper.v.1.5.chr08 88487740 5e-59
CaES3006 Pepper.v.1.5.chr08 89149757 1e-149
CaES4578 Pepper.v.1.5.chr08 89150053 1e-142
CaES4006 Pepper.v.1.5.chr08 96194135 1e-155
CaES1279 Pepper.v.1.5.chr08 96313202 1e-119
CaES3602 Pepper.v.1.5.chr08 104753130 1e-139
CaES4928 Pepper.v.1.5.chr08 104756960 1e-64
CaES3747 Pepper.v.1.5.chr08 104797811 1e-149
CaES2961 Pepper.v.1.5.chr08 110502335 1e-126
CaES1806 Pepper.v.1.5.chr08 111664983 1e-107
CaES2816 Pepper.v.1.5.chr08 111664990 6e-46
CaES4194 Pepper.v.1.5.chr08 112052700 1e-64
CaES2025 Pepper.v.1.5.chr08 112063378 1e-113
CaES3446 Pepper.v.1.5.chr08 112792951 1e-125
CaES0736 Pepper.v.1.5.chr08 113420937 1e-104
CaES5200 Pepper.v.1.5.chr08 114009858 6e-80
CaES0598 Pepper.v.1.5.chr08 116665387 1e-116
CaES3683 Pepper.v.1.5.chr08 116852425 2e-95
CaES5489 Pepper.v.1.5.chr08 116872479 3e-88
CaES0846 Pepper.v.1.5.chr08 116891307 1e-109
CaES3426 Pepper.v.1.5.chr08 119213401 3e-25
CaES1650 Pepper.v.1.5.chr08 121073883 1e-141
CaES2239 Pepper.v.1.5.chr08 121864631 1e-102
CaES4571 Pepper.v.1.5.chr08 121929170 2e-95
CaES2571 Pepper.v.1.5.chr08 122058795 3e-38
CaES4338 Pepper.v.1.5.chr08 122059056 6e-86
CaES3024 Pepper.v.1.5.chr08 122292810 1e-124
CaES4589 Pepper.v.1.5.chr08 122294980 1e-114
CaES5629 Pepper.v.1.5.chr08 122404054 2e-73
CaES3709 Pepper.v.1.5.chr08 122891153 1e-128
CaES5713 Pepper.v.1.5.chr08 123303859 6e-55
CaES0910 Pepper.v.1.5.chr08 123308225 3e-94
CaES1200 Pepper.v.1.5.chr08 123367434 3e-94
CaES5702 Pepper.v.1.5.chr08 123481355 1e-108
CaES0160 Pepper.v.1.5.chr08 123518013 1e-122
CaES5366 Pepper.v.1.5.chr08 123534931 1e-103
CaES0662 Pepper.v.1.5.chr08 123908324 5e-45
CaES2804 Pepper.v.1.5.chr08 123935110 2e-23
CaES0093 Pepper.v.1.5.chr08 123976528 7e-64
CaES4313 Pepper.v.1.5.chr08 123989450 6e-81
CaES0440 Pepper.v.1.5.chr08 124010156 3e-78
CaES1552 Pepper.v.1.5.chr08 124010439 1e-108
CaES1255 Pepper.v.1.5.chr08 124010482 2e-49
CaES4351 Pepper.v.1.5.chr08 124020349 1e-128
CaES3671 Pepper.v.1.5.chr08 124022189 1e-133
CaES1586 Pepper.v.1.5.chr08 124022193 2e-42
CaES2613 Pepper.v.1.5.chr08 124022910 6e-74
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 273


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