Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr08

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 273


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2177 Pepper.v.1.5.chr08 129055384 1e-108
CaES2178 Pepper.v.1.5.chr08 129768029 5e-90
CaES2183 Pepper.v.1.5.chr08 6240045 1e-119
CaES2197 Pepper.v.1.5.chr08 125994983 1e-120
CaES2217 Pepper.v.1.5.chr08 51154777 1e-74
CaES2220 Pepper.v.1.5.chr08 134017304 1e-145
CaES2238 Pepper.v.1.5.chr08 64484078 1e-43
CaES2239 Pepper.v.1.5.chr08 121864631 1e-102
CaES2267 Pepper.v.1.5.chr08 52180341 1e-125
CaES2274 Pepper.v.1.5.chr08 764126 1e-111
CaES2280 Pepper.v.1.5.chr08 133090447 1e-156
CaES2296 Pepper.v.1.5.chr08 133185931 2e-98
CaES2347 Pepper.v.1.5.chr08 127575392 1e-109
CaES2392 Pepper.v.1.5.chr08 126979413 1e-146
CaES2460 Pepper.v.1.5.chr08 45152390 9e-96
CaES2500 Pepper.v.1.5.chr08 131402462 1e-21
CaES2555 Pepper.v.1.5.chr08 59024118 1e-117
CaES2559 Pepper.v.1.5.chr08 124994943 1e-71
CaES2571 Pepper.v.1.5.chr08 122058795 3e-38
CaES2573 Pepper.v.1.5.chr08 35636299 2e-78
CaES2577 Pepper.v.1.5.chr08 52378736 1e-111
CaES2599 Pepper.v.1.5.chr08 689303 1e-130
CaES2604 Pepper.v.1.5.chr08 38179952 1e-142
CaES2613 Pepper.v.1.5.chr08 124022910 6e-74
CaES2645 Pepper.v.1.5.chr08 50028534 1e-103
CaES2707 Pepper.v.1.5.chr08 130798544 1e-118
CaES2715 Pepper.v.1.5.chr08 131508017 6e-79
CaES2727 Pepper.v.1.5.chr08 126440628 1e-128
CaES2735 Pepper.v.1.5.chr08 131969288 1e-136
CaES2766 Pepper.v.1.5.chr08 129952503 3e-74
CaES2783 Pepper.v.1.5.chr08 2764407 1e-72
CaES2804 Pepper.v.1.5.chr08 123935110 2e-23
CaES2810 Pepper.v.1.5.chr08 134602132 4e-55
CaES2816 Pepper.v.1.5.chr08 111664990 6e-46
CaES2835 Pepper.v.1.5.chr08 132785083 1e-111
CaES2877 Pepper.v.1.5.chr08 126001279 1e-113
CaES2891 Pepper.v.1.5.chr08 2719592 4e-36
CaES2937 Pepper.v.1.5.chr08 14800219 1e-103
CaES2945 Pepper.v.1.5.chr08 129774717 6e-76
CaES2951 Pepper.v.1.5.chr08 129327467 1e-121
CaES2961 Pepper.v.1.5.chr08 110502335 1e-126
CaES2998 Pepper.v.1.5.chr08 133248485 3e-33
CaES3006 Pepper.v.1.5.chr08 89149757 1e-149
CaES3024 Pepper.v.1.5.chr08 122292810 1e-124
CaES3043 Pepper.v.1.5.chr08 125415156 1e-118
CaES3116 Pepper.v.1.5.chr08 130581585 1e-122
CaES3129 Pepper.v.1.5.chr08 124627618 1e-111
CaES3146 Pepper.v.1.5.chr08 59535955 1e-105
CaES3161 Pepper.v.1.5.chr08 2383490 6e-97
CaES3168 Pepper.v.1.5.chr08 2692131 1e-58
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 273


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