Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr08

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 273


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1051 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr08 117252190 1e-143
CaES1129 Pepper.v.1.5.chr08 53315716 1e-133
CaES1183 Pepper.v.1.5.chr08 65445541 1e-119
CaES1184 Pepper.v.1.5.chr08 129222980 7e-64
CaES1200 Pepper.v.1.5.chr08 123367434 3e-94
CaES1220 Pepper.v.1.5.chr08 131232863 1e-112
CaES1222 Pepper.v.1.5.chr08 124845702 1e-123
CaES1255 Pepper.v.1.5.chr08 124010482 2e-49
CaES1279 Pepper.v.1.5.chr08 96313202 1e-119
CaES1283 Pepper.v.1.5.chr08 73295604 3e-96
CaES1290 Pepper.v.1.5.chr08 124116785 1e-136
CaES1324 0.0 190 Pepper.v.1.5.chr08 14761176 1e-108
CaES1352 Pepper.v.1.5.chr08 72222337 1e-133
CaES1354 Pepper.v.1.5.chr08 2942766 1e-113
CaES1389 Pepper.v.1.5.chr08 133658222 1e-111
CaES1394 Pepper.v.1.5.chr08 1279628 1e-151
CaES1459 Pepper.v.1.5.chr08 130940843 1e-123
CaES1490 Pepper.v.1.5.chr08 2926717 5e-46
CaES1517 Pepper.v.1.5.chr08 43480485 9e-67
CaES1536 Pepper.v.1.5.chr08 127569540 4e-70
CaES1552 Pepper.v.1.5.chr08 124010439 1e-108
CaES1558 Pepper.v.1.5.chr08 7474192 5e-53
CaES1559 Pepper.v.1.5.chr08 1177746 1e-51
CaES1575 Pepper.v.1.5.chr08 855376 4e-46
CaES1586 Pepper.v.1.5.chr08 124022193 2e-42
CaES1623 Pepper.v.1.5.chr08 131788083 2e-28
CaES1636 Pepper.v.1.5.chr08 126327778 1e-119
CaES1646 Pepper.v.1.5.chr08 17119695 1e-70
CaES1650 Pepper.v.1.5.chr08 121073883 1e-141
CaES1689 Pepper.v.1.5.chr08 59024818 1e-91
CaES1702 Pepper.v.1.5.chr08 74689245 4e-37
CaES1711 0.474 140 Pepper.v.1.5.chr08 131373766 2e-77
CaES1785 Pepper.v.1.5.chr08 129501130 1e-23
CaES1806 Pepper.v.1.5.chr08 111664983 1e-107
CaES1880 Pepper.v.1.5.chr08 129422488 7e-57
CaES1909 Pepper.v.1.5.chr08 130928971 1e-148
CaES1929 Pepper.v.1.5.chr08 134370053 1e-124
CaES1955 Pepper.v.1.5.chr08 126643470 1e-84
CaES1964 Pepper.v.1.5.chr08 131145655 1e-111
CaES1992 Pepper.v.1.5.chr08 1191733 1e-117
CaES2001 Pepper.v.1.5.chr08 125315911 8e-86
CaES2007 Pepper.v.1.5.chr08 126947610 5e-54
CaES2017 Pepper.v.1.5.chr08 131476105 3e-85
CaES2024 Pepper.v.1.5.chr08 38179424 1e-138
CaES2025 Pepper.v.1.5.chr08 112063378 1e-113
CaES2028 Pepper.v.1.5.chr08 46954445 1e-129
CaES2066 Pepper.v.1.5.chr08 2991416 4e-91
CaES2068 Pepper.v.1.5.chr08 85403942 1e-132
CaES2143 Pepper.v.1.5.chr08 132081611 1e-124
CaES2169 Pepper.v.1.5.chr08 131788290 4e-79
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 273


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