Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4856 Pepper.v.1.5.chr07 221230828 5e-98
CaES2303 Pepper.v.1.5.chr07 221238260 3e-78
CaES3793 Pepper.v.1.5.chr07 221249674 1e-130
CaES2799 Pepper.v.1.5.chr07 221250788 2e-98
CaES3110 Pepper.v.1.5.chr07 221314207 1e-38
CaES2418 Pepper.v.1.5.chr07 223036904 1e-116
CaES1817 Pepper.v.1.5.chr07 223165073 2e-45
CaES5031 Pepper.v.1.5.chr07 223179992 1e-143
CaES5289 Pepper.v.1.5.chr07 223190833 2e-67
CaES5218 Pepper.v.1.5.chr07 223225434 2e-79
CaES1996 Pepper.v.1.5.chr07 223250271 4e-71
CaES3567 Pepper.v.1.5.chr07 223688011 1e-122
CaES3065 Pepper.v.1.5.chr07 223721258 1e-125
CaES2942 Pepper.v.1.5.chr07 223727946 1e-95
CaES3223 Pepper.v.1.5.chr07 223750041 1e-65
CaES1398 Pepper.v.1.5.chr07 223760814 1e-122
CaES1381 Pepper.v.1.5.chr07 223763542 2e-94
CaES2838 Pepper.v.1.5.chr07 223787013 1e-119
CaES2170 Pepper.v.1.5.chr07 223793269 1e-134
CaES3660 Pepper.v.1.5.chr07 224032673 6e-60
CaES3410 Pepper.v.1.5.chr07 224134299 1e-138
CaES1764 Pepper.v.1.5.chr07 224134593 1e-119
CaES3904 Pepper.v.1.5.chr07 224286786 1e-104
CaES5575 Pepper.v.1.5.chr07 224375513 2e-56
CaES3296 Pepper.v.1.5.chr07 224430466 7e-81
CaES2667 Pepper.v.1.5.chr07 224430466 2e-96
CaES1492 Pepper.v.1.5.chr07 224768980 2e-71
CaES5326 Pepper.v.1.5.chr07 224808730 3e-46
CaES5675 Pepper.v.1.5.chr07 224878107 9e-47
CaES5346 Pepper.v.1.5.chr07 224878205 2e-38
CaES4824 Pepper.v.1.5.chr07 224886652 1e-94
CaES2083 Pepper.v.1.5.chr07 224895795 1e-125
CaES1540 Pepper.v.1.5.chr07 225141878 1e-81
CaES5197 Pepper.v.1.5.chr07 225388716 0.0
CaES4793 Pepper.v.1.5.chr07 225435348 4e-47
CaES2681 Pepper.v.1.5.chr07 225504148 3e-41
CaES2912 Pepper.v.1.5.chr07 225504489 1e-84
CaES4828 Pepper.v.1.5.chr07 225529614 1e-129
CaES1515 Pepper.v.1.5.chr07 225543595 2e-70
CaES1291 Pepper.v.1.5.chr07 225549015 1e-130
CaES0186 Pepper.v.1.5.chr07 225574093 5e-56
CaES0286 Pepper.v.1.5.chr07 225575701 8e-76
CaES5670 Pepper.v.1.5.chr07 225722459 1e-116
CaES1413 Pepper.v.1.5.chr07 225843819 1e-51
CaES2243 Pepper.v.1.5.chr07 225851316 2e-96
CaES1244 Pepper.v.1.5.chr07 225981760 1e-130
CaES0040 Pepper.v.1.5.chr07 225988084 1e-107
CaES2548 Pepper.v.1.5.chr07 226022798 1e-122
CaES1965 Pepper.v.1.5.chr07 226070269 1e-148
CaES2642 Pepper.v.1.5.chr07 226070269 2e-39
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409


MarkerDB | Capsicum annuum