Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4749 Pepper.v.1.5.chr07 18254893 1e-115
CaES4766 Pepper.v.1.5.chr07 214954278 1e-149
CaES4775 Pepper.v.1.5.chr07 3550235 1e-127
CaES4792 Pepper.v.1.5.chr07 54229376 5e-85
CaES4793 Pepper.v.1.5.chr07 225435348 4e-47
CaES4821 Pepper.v.1.5.chr07 36361636 6e-75
CaES4824 Pepper.v.1.5.chr07 224886652 1e-94
CaES4828 Pepper.v.1.5.chr07 225529614 1e-129
CaES4833 Pepper.v.1.5.chr07 139982835 1e-119
CaES4834 Pepper.v.1.5.chr07 203305939 1e-142
CaES4839 Pepper.v.1.5.chr07 169628199 2e-52
CaES4856 Pepper.v.1.5.chr07 221230828 5e-98
CaES4858 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr07 183735040 1e-145
CaES4871 Pepper.v.1.5.chr07 217302536 1e-110
CaES4874 Pepper.v.1.5.chr07 172683033 1e-109
CaES4907 Pepper.v.1.5.chr07 188019718 1e-117
CaES4927 Pepper.v.1.5.chr07 218166086 1e-105
CaES4933 Pepper.v.1.5.chr07 179677619 1e-123
CaES4962 Pepper.v.1.5.chr07 207601601 2e-91
CaES4968 Pepper.v.1.5.chr07 209841353 8e-94
CaES4988 Pepper.v.1.5.chr07 196819871 1e-102
CaES5031 Pepper.v.1.5.chr07 223179992 1e-143
CaES5084 Pepper.v.1.5.chr07 213312113 1e-145
CaES5156 Pepper.v.1.5.chr07 2057023 8e-97
CaES5197 Pepper.v.1.5.chr07 225388716 0.0
CaES5211 Pepper.v.1.5.chr07 17276167 1e-83
CaES5218 Pepper.v.1.5.chr07 223225434 2e-79
CaES5229 Pepper.v.1.5.chr07 218952779 1e-124
CaES5247 Pepper.v.1.5.chr07 111412075 1e-133
CaES5258 Pepper.v.1.5.chr07 219612165 4e-90
CaES5262 Pepper.v.1.5.chr07 5913273 3e-36
CaES5269 Pepper.v.1.5.chr07 50592586 8e-72
CaES5279 Pepper.v.1.5.chr07 10031151 1e-109
CaES5280 Pepper.v.1.5.chr07 82533651 4e-97
CaES5289 Pepper.v.1.5.chr07 223190833 2e-67
CaES5319 Pepper.v.1.5.chr07 220357075 8e-42
CaES5326 Pepper.v.1.5.chr07 224808730 3e-46
CaES5346 Pepper.v.1.5.chr07 224878205 2e-38
CaES5353 Pepper.v.1.5.chr07 63017521 1e-111
CaES5356 Pepper.v.1.5.chr07 322024 1e-107
CaES5367 Pepper.v.1.5.chr07 112662336 2e-94
CaES5369 Pepper.v.1.5.chr07 94520393 2e-51
CaES5397 Pepper.v.1.5.chr07 14980552 2e-78
CaES5412 Pepper.v.1.5.chr07 179717614 4e-71
CaES5442 Pepper.v.1.5.chr07 82018172 4e-85
CaES5513 Pepper.v.1.5.chr07 16098471 5e-40
CaES5565 Pepper.v.1.5.chr07 117967430 1e-100
CaES5575 Pepper.v.1.5.chr07 224375513 2e-56
CaES5580 Pepper.v.1.5.chr07 210035499 1e-101
CaES5592 Pepper.v.1.5.chr07 220926751 1e-88
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409


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