Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES4004 Pepper.v.1.5.chr07 7352964 1e-146
CaES4017 Pepper.v.1.5.chr07 217044686 1e-119
CaES4025 Pepper.v.1.5.chr07 698921 3e-67
CaES4028 Pepper.v.1.5.chr07 127612719 1e-124
CaES4029 Pepper.v.1.5.chr07 98423 1e-74
CaES4070 Pepper.v.1.5.chr07 227541693 2e-66
CaES4071 Pepper.v.1.5.chr07 185258041 1e-123
CaES4074 Pepper.v.1.5.chr07 220649101 1e-108
CaES4089 Pepper.v.1.5.chr07 2631751 2e-70
CaES4093 Pepper.v.1.5.chr07 217392127 2e-22
CaES4102 Pepper.v.1.5.chr07 211341122 1e-72
CaES4103 Pepper.v.1.5.chr07 182151055 1e-116
CaES4163 Pepper.v.1.5.chr07 2100873 1e-99
CaES4207 Pepper.v.1.5.chr07 226944881 1e-112
CaES4227 Pepper.v.1.5.chr07 35026384 2e-98
CaES4243 Pepper.v.1.5.chr07 52962942 1e-101
CaES4255 Pepper.v.1.5.chr07 99464301 1e-141
CaES4264 Pepper.v.1.5.chr07 221050638 1e-118
CaES4266 Pepper.v.1.5.chr07 11519255 2e-40
CaES4280 Pepper.v.1.5.chr07 150027577 1e-147
CaES4286 Pepper.v.1.5.chr07 119278890 1e-138
CaES4303 Pepper.v.1.5.chr07 111411817 9e-35
CaES4306 Pepper.v.1.5.chr07 37010875 1e-57
CaES4310 Pepper.v.1.5.chr07 220935636 1e-148
CaES4337 Pepper.v.1.5.chr07 94334990 1e-120
CaES4357 Pepper.v.1.5.chr07 219846706 7e-87
CaES4360 Pepper.v.1.5.chr07 23670575 1e-108
CaES4370 Pepper.v.1.5.chr07 120193746 2e-60
CaES4387 Pepper.v.1.5.chr07 81381509 1e-130
CaES4431 Pepper.v.1.5.chr07 220919751 1e-132
CaES4439 Pepper.v.1.5.chr07 78498245 1e-153
CaES4440 Pepper.v.1.5.chr07 116801410 1e-112
CaES4451 Pepper.v.1.5.chr07 154258497 1e-118
CaES4470 Pepper.v.1.5.chr07 218167155 1e-106
CaES4473 Pepper.v.1.5.chr07 219307676 4e-21
CaES4485 Pepper.v.1.5.chr07 127594991 1e-107
CaES4515 Pepper.v.1.5.chr07 205439615 3e-92
CaES4519 Pepper.v.1.5.chr07 217391723 1e-135
CaES4520 Pepper.v.1.5.chr07 190883674 1e-91
CaES4543 Pepper.v.1.5.chr07 197902068 6e-92
CaES4547 Pepper.v.1.5.chr07 67203161 5e-73
CaES4584 0.297 192 Pepper.v.1.5.chr07 226826127 4e-90
CaES4656 Pepper.v.1.5.chr07 215462715 1e-116
CaES4675 Pepper.v.1.5.chr07 2411248 1e-127
CaES4679 Pepper.v.1.5.chr07 216396369 5e-66
CaES4716 Pepper.v.1.5.chr07 201747297 1e-119
CaES4722 Pepper.v.1.5.chr07 218220175 1e-163
CaES4731 Pepper.v.1.5.chr07 120203698 2e-79
CaES4739 Pepper.v.1.5.chr07 216396369 6e-40
CaES4746 Pepper.v.1.5.chr07 892917 3e-51
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409

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